Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP8

PAPPA2, Pappalysin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,791 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPPA2Q9BXP8 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PAPPA2Q9BXP8 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PAPPA2Q9BXP8 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PAPPA2Q9BXP8 OR7E12P-201ENST00000344740 973 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PAPPA2Q9BXP8 IGLJ1-201ENST00000390320 127 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PAPPA2Q9BXP8 AC015691.1-201ENST00000394793 535 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PAPPA2Q9BXP8 AC005077.3-201ENST00000449614 213 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PAPPA2Q9BXP8 LINC00643-202ENST00000553426 526 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PAPPA2Q9BXP8 LIMD2-210ENST00000582055 509 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PAPPA2Q9BXP8 AC100786.1-201ENST00000583018 513 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PAPPA2Q9BXP8 ITGB2-AS1-204ENST00000609592 482 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PAPPA2Q9BXP8 COG6-212ENST00000630730 186 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PAPPA2Q9BXP8 NR1I2-206ENST00000638727 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PAPPA2Q9BXP8 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PAPPA2Q9BXP8 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PAPPA2Q9BXP8 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PAPPA2Q9BXP8 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PAPPA2Q9BXP8 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PAPPA2Q9BXP8 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PAPPA2Q9BXP8 YIPF1-201ENST00000072644 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PAPPA2Q9BXP8 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PAPPA2Q9BXP8 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAPPA2Q9BXP8 AL137077.2-201ENST00000635124 1608 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PAPPA2Q9BXP8 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAPPA2Q9BXP8 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAPPA2Q9BXP8 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAPPA2Q9BXP8 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAPPA2Q9BXP8 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAPPA2Q9BXP8 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAPPA2Q9BXP8 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAPPA2Q9BXP8 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAPPA2Q9BXP8 MIR1226-201ENST00000408658 75 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PAPPA2Q9BXP8 LINC00388-201ENST00000412714 663 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAPPA2Q9BXP8 CRIP1P2-201ENST00000425396 228 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PAPPA2Q9BXP8 TBX5-AS1-202ENST00000531024 766 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAPPA2Q9BXP8 SRD5A3-AS1-203ENST00000591915 709 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAPPA2Q9BXP8 AC138627.1-201ENST00000641127 1257 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PAPPA2Q9BXP8 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAPPA2Q9BXP8 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAPPA2Q9BXP8 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PAPPA2Q9BXP8 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAPPA2Q9BXP8 EPB42-203ENST00000540029 2098 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAPPA2Q9BXP8 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAPPA2Q9BXP8 UBE2V1-224ENST00000625172 2297 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAPPA2Q9BXP8 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAPPA2Q9BXP8 ZSCAN2-202ENST00000327179 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAPPA2Q9BXP8 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAPPA2Q9BXP8 GTF2A1L-201ENST00000403751 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAPPA2Q9BXP8 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAPPA2Q9BXP8 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAPPA2Q9BXP8 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAPPA2Q9BXP8 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAPPA2Q9BXP8 XRN1-203ENST00000463916 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAPPA2Q9BXP8 KDF1-202ENST00000616918 1651 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAPPA2Q9BXP8 TCL1A-201ENST00000402399 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAPPA2Q9BXP8 BLVRA-201ENST00000265523 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAPPA2Q9BXP8 OR6S1-201ENST00000320704 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAPPA2Q9BXP8 UGT1A12P-201ENST00000447084 853 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PAPPA2Q9BXP8 PRSS46-201ENST00000463091 982 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAPPA2Q9BXP8 AF186996.6-201ENST00000485294 149 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PAPPA2Q9BXP8 AC117834.1-201ENST00000523197 602 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAPPA2Q9BXP8 PCTP-206ENST00000573500 919 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PAPPA2Q9BXP8 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PAPPA2Q9BXP8 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PAPPA2Q9BXP8 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PAPPA2Q9BXP8 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PAPPA2Q9BXP8 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PAPPA2Q9BXP8 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PAPPA2Q9BXP8 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PAPPA2Q9BXP8 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PAPPA2Q9BXP8 CASP8-212ENST00000432109 1629 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PAPPA2Q9BXP8 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PAPPA2Q9BXP8 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PAPPA2Q9BXP8 GOSR2-209ENST00000575949 1444 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PAPPA2Q9BXP8 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PAPPA2Q9BXP8 MAD2L1BP-201ENST00000372171 1301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PAPPA2Q9BXP8 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PAPPA2Q9BXP8 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PAPPA2Q9BXP8 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PAPPA2Q9BXP8 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PAPPA2Q9BXP8 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PAPPA2Q9BXP8 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PAPPA2Q9BXP8 INCA1-201ENST00000355025 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PAPPA2Q9BXP8 POLR1C-203ENST00000372389 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PAPPA2Q9BXP8 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
PAPPA2Q9BXP8 TAMM41-201ENST00000273037 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PAPPA2Q9BXP8 RNASEH2CP1-201ENST00000454281 502 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
PAPPA2Q9BXP8 C10orf90-207ENST00000480379 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PAPPA2Q9BXP8 AL513165.2-203ENST00000537239 717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PAPPA2Q9BXP8 AC092720.1-202ENST00000565824 555 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PAPPA2Q9BXP8 FXYD4-204ENST00000616495 778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PAPPA2Q9BXP8 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PAPPA2Q9BXP8 AL031590.1-202ENST00000641466 1737 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
PAPPA2Q9BXP8 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PAPPA2Q9BXP8 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PAPPA2Q9BXP8 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PAPPA2Q9BXP8 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PAPPA2Q9BXP8 RSPH4A-202ENST00000368580 1410 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PAPPA2Q9BXP8 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PAPPA2Q9BXP8 MCRS1-203ENST00000546244 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.5 ms