Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

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Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 C5AR1-201ENST00000355085 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 TMPRSS13-205ENST00000526090 2592 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 PRRT2-201ENST00000300797 3002 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 SLC4A5-202ENST00000358683 3142 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 YTHDF3-201ENST00000517371 3122 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 LINC-PINT-208ENST00000451786 3505 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 DPP10-201ENST00000310323 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 ZSWIM3-201ENST00000255152 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 FAM106A-201ENST00000392176 2281 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 CES1P1-201ENST00000421606 1704 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 AL672207.1-201ENST00000328462 1570 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 AFF1-201ENST00000307808 9390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 TMEM95-201ENST00000330767 1169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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SPOCK3Q9BQ16 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
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SPOCK3Q9BQ16 AC026191.1-204ENST00000517846 608 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 USP3-AS1-204ENST00000559861 620 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 C17orf62-216ENST00000578919 841 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 AP005264.6-204ENST00000588436 719 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
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SPOCK3Q9BQ16 TTC23L-209ENST00000638320 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 GDPD5-202ENST00000443276 3106 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 TVP23C-CDRT4-203ENST00000522212 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 KRT74-201ENST00000305620 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 GTF2IRD1P1-202ENST00000457166 2426 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 VIPAS39-206ENST00000553888 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 KIR2DS4-201ENST00000339924 1608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SPOCK3Q9BQ16 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
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