Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXT5

FOXD4L4, Forkhead box protein D4-like 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L4Q8WXT5 CCNY-203ENST00000374704 3960 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
FOXD4L4Q8WXT5 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXD4L4Q8WXT5 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXD4L4Q8WXT5 ARHGEF2-201ENST00000313667 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXD4L4Q8WXT5 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXD4L4Q8WXT5 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXD4L4Q8WXT5 CENPL-202ENST00000356198 2357 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXD4L4Q8WXT5 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXD4L4Q8WXT5 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXD4L4Q8WXT5 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXD4L4Q8WXT5 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXD4L4Q8WXT5 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXD4L4Q8WXT5 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXD4L4Q8WXT5 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXD4L4Q8WXT5 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXD4L4Q8WXT5 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXD4L4Q8WXT5 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXD4L4Q8WXT5 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXD4L4Q8WXT5 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXD4L4Q8WXT5 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXD4L4Q8WXT5 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXD4L4Q8WXT5 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXD4L4Q8WXT5 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXD4L4Q8WXT5 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXD4L4Q8WXT5 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXD4L4Q8WXT5 OS9-218ENST00000551035 2246 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXD4L4Q8WXT5 CRISPLD2-209ENST00000567845 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXD4L4Q8WXT5 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXD4L4Q8WXT5 ZMYND15-206ENST00000592813 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXD4L4Q8WXT5 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXD4L4Q8WXT5 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXD4L4Q8WXT5 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXD4L4Q8WXT5 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXD4L4Q8WXT5 STK38L-201ENST00000389032 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXD4L4Q8WXT5 STIM1-220ENST00000616714 4356 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXD4L4Q8WXT5 AC239809.3-201ENST00000599640 4266 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXD4L4Q8WXT5 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXD4L4Q8WXT5 AC108002.1-201ENST00000520572 5684 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXD4L4Q8WXT5 NEK4-202ENST00000383721 2576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FOXD4L4Q8WXT5 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXD4L4Q8WXT5 MATN1-AS1-201ENST00000414532 3925 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXD4L4Q8WXT5 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXD4L4Q8WXT5 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXD4L4Q8WXT5 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXD4L4Q8WXT5 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXD4L4Q8WXT5 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXD4L4Q8WXT5 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXD4L4Q8WXT5 HPS3-201ENST00000296051 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXD4L4Q8WXT5 VILL-201ENST00000283713 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXD4L4Q8WXT5 SIRPA-203ENST00000400068 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXD4L4Q8WXT5 ASB2-201ENST00000315988 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXD4L4Q8WXT5 POLM-201ENST00000242248 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXD4L4Q8WXT5 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXD4L4Q8WXT5 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXD4L4Q8WXT5 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXD4L4Q8WXT5 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXD4L4Q8WXT5 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXD4L4Q8WXT5 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXD4L4Q8WXT5 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXD4L4Q8WXT5 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXD4L4Q8WXT5 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXD4L4Q8WXT5 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXD4L4Q8WXT5 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXD4L4Q8WXT5 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXD4L4Q8WXT5 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXD4L4Q8WXT5 PPFIA4-204ENST00000447715 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXD4L4Q8WXT5 ARAF-201ENST00000290277 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXD4L4Q8WXT5 CASC4-202ENST00000345795 3764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXD4L4Q8WXT5 AL162431.2-201ENST00000358073 2424 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXD4L4Q8WXT5 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXD4L4Q8WXT5 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXD4L4Q8WXT5 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXD4L4Q8WXT5 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXD4L4Q8WXT5 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXD4L4Q8WXT5 ELAVL1-201ENST00000407627 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXD4L4Q8WXT5 APOBEC3D-202ENST00000427494 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXD4L4Q8WXT5 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXD4L4Q8WXT5 MKX-201ENST00000375790 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXD4L4Q8WXT5 ADGRG3-201ENST00000333493 2728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXD4L4Q8WXT5 DHX30-215ENST00000619982 3574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXD4L4Q8WXT5 C21orf59-203ENST00000382549 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXD4L4Q8WXT5 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXD4L4Q8WXT5 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXD4L4Q8WXT5 TNFRSF8-201ENST00000263932 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXD4L4Q8WXT5 TNFRSF8-203ENST00000417814 3593 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXD4L4Q8WXT5 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXD4L4Q8WXT5 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXD4L4Q8WXT5 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXD4L4Q8WXT5 CRY2-212ENST00000616623 4204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXD4L4Q8WXT5 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXD4L4Q8WXT5 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXD4L4Q8WXT5 SEC23A-201ENST00000307712 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXD4L4Q8WXT5 AL772337.1-201ENST00000399186 2014 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXD4L4Q8WXT5 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXD4L4Q8WXT5 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXD4L4Q8WXT5 RNF43-205ENST00000581868 2610 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXD4L4Q8WXT5 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXD4L4Q8WXT5 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXD4L4Q8WXT5 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXD4L4Q8WXT5 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms