Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 SNRNP27-201ENST00000244227 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 ZNF774-201ENST00000354377 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 SEPT6-201ENST00000343984 2693 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 KLHL13-209ENST00000545703 3322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 FAM212B-AS1-201ENST00000430373 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 AC000120.1-201ENST00000414227 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 CNOT7-211ENST00000523917 1885 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 CDK20-209ENST00000605159 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 PI4KAP2-201ENST00000360806 2080 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 DRD2-208ENST00000542968 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 IL2RG-203ENST00000374202 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 CNBP-203ENST00000446936 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 CNBP-204ENST00000451728 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 KIAA0895-203ENST00000338533 4132 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 DYNC1I1-201ENST00000324972 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 RHPN1-AS1-201ENST00000518049 1918 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 CICP1-201ENST00000416803 2410 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 STX3-207ENST00000633708 3111 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 AC034228.2-201ENST00000432558 459 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 CYB5D1-203ENST00000571846 1870 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 CDC45-205ENST00000437685 2072 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 SECISBP2-202ENST00000375807 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 CATSPERD-202ENST00000381624 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 DNAJC14-202ENST00000317287 2774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 ZNF573-204ENST00000392138 2266 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 NIT1-202ENST00000368008 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 ACVR1B-202ENST00000415850 1665 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 GIPR-205ENST00000590918 3289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 FOXN4-202ENST00000355216 2958 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 453.8 ms