Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSL9

STRIP1, Striatin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRIP1Q5VSL9 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 CHRNA1-203ENST00000409219 1466 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 MDM1-205ENST00000430606 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 FCRL6-202ENST00000339348 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 CNMD-203ENST00000448904 1444 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 HEXA-206ENST00000566304 1795 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 KRTAP4-12-201ENST00000394014 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 AL357373.1-201ENST00000394974 322 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 AL365500.1-201ENST00000442783 868 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 AC079250.1-201ENST00000456046 531 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 AC092896.1-201ENST00000465850 380 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 AC025594.1-201ENST00000469533 543 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 AC099548.2-201ENST00000491047 571 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 RHOH-206ENST00000505618 1225 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 BCRP4-201ENST00000506079 804 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 AC025171.3-201ENST00000509036 472 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 AC090617.4-201ENST00000572404 422 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 STAG3L1-204ENST00000619870 1192 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 EIF3F-209ENST00000640290 372 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 CD79B-201ENST00000006750 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 MEFV-203ENST00000536379 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 WIPI1-201ENST00000262139 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 RERG-201ENST00000256953 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 SLC50A1-203ENST00000368404 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 ART3-201ENST00000341029 1517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 UBE2L5P-202ENST00000635918 1513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 PHTF2-204ENST00000415251 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 TEX33-201ENST00000381821 978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 SKOR2-201ENST00000400404 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 AC092810.2-201ENST00000431570 362 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 CLDN25-201ENST00000453129 754 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 AC128689.1-202ENST00000459861 827 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 S100A2-205ENST00000487430 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 RN7SL605P-201ENST00000577229 281 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
STRIP1Q5VSL9 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
STRIP1Q5VSL9 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
STRIP1Q5VSL9 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
STRIP1Q5VSL9 NIFK-AS1-203ENST00000419902 1316 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
STRIP1Q5VSL9 C20orf96-202ENST00000382369 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
STRIP1Q5VSL9 AC003986.1-201ENST00000452700 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
STRIP1Q5VSL9 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
STRIP1Q5VSL9 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
STRIP1Q5VSL9 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
STRIP1Q5VSL9 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
STRIP1Q5VSL9 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
STRIP1Q5VSL9 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.4 ms