Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTXN3Q4LDR2 FLJ37035-201ENST00000419400 446 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTXN3Q4LDR2 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTXN3Q4LDR2 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTXN3Q4LDR2 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTXN3Q4LDR2 HINT1-205ENST00000508488 703 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTXN3Q4LDR2 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CTXN3Q4LDR2 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTXN3Q4LDR2 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTXN3Q4LDR2 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CTXN3Q4LDR2 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CTXN3Q4LDR2 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTXN3Q4LDR2 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTXN3Q4LDR2 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTXN3Q4LDR2 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTXN3Q4LDR2 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTXN3Q4LDR2 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CTXN3Q4LDR2 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTXN3Q4LDR2 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTXN3Q4LDR2 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTXN3Q4LDR2 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTXN3Q4LDR2 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTXN3Q4LDR2 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTXN3Q4LDR2 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTXN3Q4LDR2 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTXN3Q4LDR2 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTXN3Q4LDR2 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTXN3Q4LDR2 GOT2-202ENST00000434819 1615 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTXN3Q4LDR2 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTXN3Q4LDR2 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTXN3Q4LDR2 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTXN3Q4LDR2 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTXN3Q4LDR2 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTXN3Q4LDR2 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTXN3Q4LDR2 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTXN3Q4LDR2 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTXN3Q4LDR2 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTXN3Q4LDR2 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTXN3Q4LDR2 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTXN3Q4LDR2 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTXN3Q4LDR2 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTXN3Q4LDR2 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTXN3Q4LDR2 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTXN3Q4LDR2 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTXN3Q4LDR2 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTXN3Q4LDR2 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CTXN3Q4LDR2 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTXN3Q4LDR2 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTXN3Q4LDR2 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTXN3Q4LDR2 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTXN3Q4LDR2 IGHV1-3-201ENST00000390595 395 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTXN3Q4LDR2 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTXN3Q4LDR2 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTXN3Q4LDR2 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CTXN3Q4LDR2 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTXN3Q4LDR2 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTXN3Q4LDR2 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTXN3Q4LDR2 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTXN3Q4LDR2 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CTXN3Q4LDR2 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CTXN3Q4LDR2 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTXN3Q4LDR2 MIR4265-201ENST00000582152 99 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CTXN3Q4LDR2 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTXN3Q4LDR2 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CTXN3Q4LDR2 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CTXN3Q4LDR2 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTXN3Q4LDR2 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTXN3Q4LDR2 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTXN3Q4LDR2 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTXN3Q4LDR2 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTXN3Q4LDR2 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTXN3Q4LDR2 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CTXN3Q4LDR2 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTXN3Q4LDR2 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTXN3Q4LDR2 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTXN3Q4LDR2 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTXN3Q4LDR2 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTXN3Q4LDR2 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTXN3Q4LDR2 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTXN3Q4LDR2 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTXN3Q4LDR2 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTXN3Q4LDR2 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTXN3Q4LDR2 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTXN3Q4LDR2 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTXN3Q4LDR2 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTXN3Q4LDR2 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTXN3Q4LDR2 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTXN3Q4LDR2 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTXN3Q4LDR2 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTXN3Q4LDR2 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTXN3Q4LDR2 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTXN3Q4LDR2 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTXN3Q4LDR2 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTXN3Q4LDR2 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTXN3Q4LDR2 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTXN3Q4LDR2 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTXN3Q4LDR2 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTXN3Q4LDR2 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTXN3Q4LDR2 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTXN3Q4LDR2 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.8 ms