Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 ZNF706-209ENST00000520347 3502 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 MNT-201ENST00000174618 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 SEC23A-201ENST00000307712 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 UBN1-202ENST00000396658 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 NCBP1-202ENST00000375147 5178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 PRPF40B-209ENST00000548825 3307 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 TNRC18P1-201ENST00000502875 3650 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 GTF2IRD2B-203ENST00000472837 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 DLGAP1-203ENST00000400147 5258 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 DLGAP1-206ENST00000400155 5257 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 TNS1-207ENST00000430930 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 PTPRN2-203ENST00000389418 4706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 KLHL13-209ENST00000545703 3322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 HPSE-201ENST00000311412 4615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 DLGAP3-202ENST00000373347 3856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 COL6A3-202ENST00000347401 8625 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 COL6A3-209ENST00000472056 8628 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 MTMR2-201ENST00000346299 4681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 MTMR2-203ENST00000393223 4681 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 TMEM164-203ENST00000372072 4975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 RNF43-208ENST00000584437 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 GRAMD4-201ENST00000361034 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 TRIM4-201ENST00000349062 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 OTOA-203ENST00000388957 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 KAZN-205ENST00000400798 3643 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 LINC00869-206ENST00000610578 5734 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 AL353608.3-202ENST00000429953 4384 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.9 ms