Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 RNF146-211ENST00000609447 607 ntTSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 AC073592.2-201ENST00000623062 780 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 LINC02557-201ENST00000432249 477 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 DNAJB13-203ENST00000537753 912 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 UXT-AS1-202ENST00000591832 565 ntTSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
E2F1Q01094 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 PRRC2B-207ENST00000458550 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 RN7SL23P-201ENST00000484055 275 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.8 ms