Protein–RNA interactions for Protein: P68371

TUBB4B, Tubulin beta-4B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4BP68371 SH2D3C-201ENST00000314830 3124 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 DYNC1I2-203ENST00000409197 2572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 DYNC1I2-206ENST00000409773 2583 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 AC036108.2-201ENST00000566974 2562 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 TRIM11-204ENST00000493030 5774 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 CREBZF-204ENST00000527447 4037 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 TCP11L1-209ENST00000531632 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 ANXA11-201ENST00000265447 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 MARK2-205ENST00000408948 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 TGM1-201ENST00000206765 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 LDB3-202ENST00000361373 5297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 TYK2-205ENST00000525621 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 IGFN1-201ENST00000295591 4439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 TMC8-201ENST00000318430 4411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 GLB1L-201ENST00000295759 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 GTF2IRD2B-203ENST00000472837 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 C19orf33-201ENST00000301246 467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 AC011479.1-202ENST00000591889 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 SKA3-202ENST00000314759 2919 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 ZNF410-201ENST00000324593 2293 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 PTCHD3-201ENST00000438700 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 PIK3R6-204ENST00000619866 3041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 SLC37A4-202ENST00000357590 2356 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 PRKN-205ENST00000366897 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 GDAP1L1-208ENST00000617075 2645 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 AC004623.1-201ENST00000624592 2127 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 MED16-202ENST00000312090 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 AL133387.2-201ENST00000422661 2222 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 AGAP2-203ENST00000547588 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 TMEM41A-203ENST00000421852 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 EFEMP1-201ENST00000355426 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 IL11RA-208ENST00000555003 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 WASHC5-202ENST00000517845 3667 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 CCT3-211ENST00000472765 1858 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 GTF2IRD2-201ENST00000451013 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 KDM5C-208ENST00000452825 6096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 CD22-209ENST00000594250 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 USH1G-202ENST00000614341 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 TMEM40-205ENST00000435575 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 TBC1D24-201ENST00000293970 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 SECISBP2-201ENST00000339901 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 SPTBN2-210ENST00000611817 2890 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 SIX1-203ENST00000554986 1959 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 RAB37-204ENST00000392613 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 RRM2B-211ENST00000621845 3483 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 CCDC57-202ENST00000389641 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 CCDC57-206ENST00000392347 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 CNTD1-204ENST00000588408 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 COG6-202ENST00000416691 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TUBB4BP68371 NUDT9-203ENST00000473942 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms