Protein–RNA interactions for Protein: P40222

TXLNA, Alpha-taxilin, humanhuman

Predictions only

Length 546 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXLNAP40222 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TXLNAP40222 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TXLNAP40222 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TXLNAP40222 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TXLNAP40222 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TXLNAP40222 NPC1-201ENST00000269228 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TXLNAP40222 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TXLNAP40222 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TXLNAP40222 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TXLNAP40222 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TXLNAP40222 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TXLNAP40222 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TXLNAP40222 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TXLNAP40222 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TXLNAP40222 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TXLNAP40222 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TXLNAP40222 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TXLNAP40222 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TXLNAP40222 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TXLNAP40222 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TXLNAP40222 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TXLNAP40222 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TXLNAP40222 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TXLNAP40222 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TXLNAP40222 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TXLNAP40222 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TXLNAP40222 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TXLNAP40222 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TXLNAP40222 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TXLNAP40222 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TXLNAP40222 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TXLNAP40222 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TXLNAP40222 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TXLNAP40222 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TXLNAP40222 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TXLNAP40222 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TXLNAP40222 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TXLNAP40222 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TXLNAP40222 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TXLNAP40222 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TXLNAP40222 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TXLNAP40222 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TXLNAP40222 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TXLNAP40222 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TXLNAP40222 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TXLNAP40222 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TXLNAP40222 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TXLNAP40222 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TXLNAP40222 SGSM1-206ENST00000610372 5991 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TXLNAP40222 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TXLNAP40222 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TXLNAP40222 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TXLNAP40222 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TXLNAP40222 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TXLNAP40222 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TXLNAP40222 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TXLNAP40222 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TXLNAP40222 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TXLNAP40222 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TXLNAP40222 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TXLNAP40222 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TXLNAP40222 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TXLNAP40222 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TXLNAP40222 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TXLNAP40222 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TXLNAP40222 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TXLNAP40222 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TXLNAP40222 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TXLNAP40222 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TXLNAP40222 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TXLNAP40222 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TXLNAP40222 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TXLNAP40222 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TXLNAP40222 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TXLNAP40222 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TXLNAP40222 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TXLNAP40222 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TXLNAP40222 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TXLNAP40222 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TXLNAP40222 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TXLNAP40222 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TXLNAP40222 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TXLNAP40222 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TXLNAP40222 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TXLNAP40222 ZMIZ2-206ENST00000441627 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TXLNAP40222 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TXLNAP40222 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TXLNAP40222 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TXLNAP40222 ASAP1-201ENST00000357668 6344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TXLNAP40222 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
TXLNAP40222 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TXLNAP40222 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TXLNAP40222 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TXLNAP40222 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TXLNAP40222 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TXLNAP40222 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TXLNAP40222 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TXLNAP40222 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TXLNAP40222 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TXLNAP40222 TRMT1L-201ENST00000367506 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.6 ms