Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGAEP38570 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms