Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PRKCHP24723 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms