Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 CD300LG-203ENST00000377203 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 GNG10P1-201ENST00000452289 199 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 AC006529.1-201ENST00000459978 637 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 AC025186.1-201ENST00000478174 870 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 CD81-209ENST00000492627 886 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 EEF1GP8-201ENST00000506566 1154 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 RFX8-201ENST00000428343 1686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 PPARG-205ENST00000397010 2017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 PLA2G12B-201ENST00000373032 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 MDS2-201ENST00000374555 1029 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 GRAMD1A-203ENST00000424536 808 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 AP001062.3-202ENST00000444409 619 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 AC005486.1-201ENST00000466775 216 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 LAMTOR4-209ENST00000488241 613 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 AL049840.2-201ENST00000602722 535 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 IMMT-212ENST00000620815 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 CACNA1A-211ENST00000592864 1623 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 NIPA1-207ENST00000561183 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 SNRPC-201ENST00000244520 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 PLAC9-203ENST00000372270 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 DSTN-203ENST00000474024 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 AC093909.3-201ENST00000504783 336 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 TNFSF13B-206ENST00000542136 495 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 AC023825.2-201ENST00000562970 672 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 AL451007.2-201ENST00000632004 563 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGA6P23229 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms