Protein–RNA interactions for Protein: P20936

RASA1, Ras GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,047 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASA1P20936 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RASA1P20936 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RASA1P20936 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RASA1P20936 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RASA1P20936 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RASA1P20936 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RASA1P20936 TPM3-211ENST00000368531 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RASA1P20936 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RASA1P20936 CYB561D1-203ENST00000393709 620 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RASA1P20936 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RASA1P20936 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RASA1P20936 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RASA1P20936 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RASA1P20936 AC120057.1-201ENST00000483947 663 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RASA1P20936 HINT1-205ENST00000508488 703 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RASA1P20936 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RASA1P20936 AL132994.1-201ENST00000554098 400 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RASA1P20936 RN7SL371P-201ENST00000578099 267 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RASA1P20936 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RASA1P20936 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RASA1P20936 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RASA1P20936 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RASA1P20936 AC003986.1-201ENST00000452700 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RASA1P20936 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RASA1P20936 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RASA1P20936 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RASA1P20936 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RASA1P20936 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RASA1P20936 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RASA1P20936 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RASA1P20936 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RASA1P20936 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RASA1P20936 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RASA1P20936 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RASA1P20936 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RASA1P20936 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RASA1P20936 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RASA1P20936 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RASA1P20936 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RASA1P20936 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RASA1P20936 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RASA1P20936 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RASA1P20936 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RASA1P20936 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RASA1P20936 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RASA1P20936 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RASA1P20936 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RASA1P20936 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RASA1P20936 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RASA1P20936 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RASA1P20936 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RASA1P20936 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RASA1P20936 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RASA1P20936 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RASA1P20936 EEF1DP2-201ENST00000433698 843 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RASA1P20936 AC253536.3-201ENST00000444093 558 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RASA1P20936 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RASA1P20936 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RASA1P20936 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RASA1P20936 AL049840.2-201ENST00000602722 535 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RASA1P20936 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RASA1P20936 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RASA1P20936 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RASA1P20936 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RASA1P20936 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RASA1P20936 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RASA1P20936 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RASA1P20936 AC061965.1-201ENST00000560524 1465 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RASA1P20936 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RASA1P20936 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RASA1P20936 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RASA1P20936 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RASA1P20936 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RASA1P20936 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RASA1P20936 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RASA1P20936 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RASA1P20936 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RASA1P20936 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RASA1P20936 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RASA1P20936 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RASA1P20936 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RASA1P20936 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RASA1P20936 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RASA1P20936 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RASA1P20936 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RASA1P20936 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RASA1P20936 ZFP1-201ENST00000332307 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RASA1P20936 CNBP-205ENST00000500450 1516 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RASA1P20936 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RASA1P20936 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RASA1P20936 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RASA1P20936 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RASA1P20936 SPRY4-AS1-203ENST00000443800 566 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RASA1P20936 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RASA1P20936 PRSS3P1-201ENST00000503996 742 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RASA1P20936 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RASA1P20936 ADM-203ENST00000525063 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RASA1P20936 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RASA1P20936 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RASA1P20936 SOCS2-AS1-204ENST00000551626 618 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.5 ms