Protein–RNA interactions for Protein: P13646

KRT13, Keratin, type I cytoskeletal 13, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT13P13646 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
KRT13P13646 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KRT13P13646 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KRT13P13646 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KRT13P13646 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KRT13P13646 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KRT13P13646 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KRT13P13646 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KRT13P13646 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KRT13P13646 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KRT13P13646 EPB41L1-202ENST00000338074 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KRT13P13646 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRT13P13646 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRT13P13646 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRT13P13646 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRT13P13646 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRT13P13646 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
KRT13P13646 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRT13P13646 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRT13P13646 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRT13P13646 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRT13P13646 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRT13P13646 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRT13P13646 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRT13P13646 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
KRT13P13646 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRT13P13646 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRT13P13646 ABCC10-204ENST00000372530 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRT13P13646 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRT13P13646 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRT13P13646 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRT13P13646 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRT13P13646 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRT13P13646 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRT13P13646 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRT13P13646 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRT13P13646 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRT13P13646 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRT13P13646 MYBBP1A-201ENST00000254718 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KRT13P13646 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT13P13646 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT13P13646 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT13P13646 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT13P13646 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT13P13646 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT13P13646 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT13P13646 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT13P13646 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT13P13646 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT13P13646 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT13P13646 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT13P13646 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT13P13646 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT13P13646 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT13P13646 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT13P13646 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT13P13646 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT13P13646 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT13P13646 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT13P13646 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT13P13646 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT13P13646 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT13P13646 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT13P13646 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT13P13646 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT13P13646 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT13P13646 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT13P13646 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT13P13646 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT13P13646 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT13P13646 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT13P13646 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT13P13646 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT13P13646 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT13P13646 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT13P13646 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT13P13646 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT13P13646 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT13P13646 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT13P13646 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT13P13646 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT13P13646 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KRT13P13646 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT13P13646 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT13P13646 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT13P13646 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT13P13646 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT13P13646 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT13P13646 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT13P13646 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT13P13646 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT13P13646 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT13P13646 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT13P13646 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT13P13646 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT13P13646 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT13P13646 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT13P13646 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT13P13646 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT13P13646 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms