Protein–RNA interactions for Protein: A6NEF3

GOLGA6L4, Golgin subfamily A member 6-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L4A6NEF3 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 TRPA1-201ENST00000262209 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 SYMPK-214ENST00000599814 6537 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 TNRC18P1-201ENST00000502875 3650 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 MFSD8-241ENST00000641686 4991 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 USP19-202ENST00000398888 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 AC135782.3-201ENST00000562782 2105 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 AC010336.1-201ENST00000539278 4739 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 MYO9A-202ENST00000424560 4008 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 BRD1-201ENST00000216267 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 ADM2-202ENST00000395738 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 KRT17P5-203ENST00000445433 2333 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 BCAP29-201ENST00000005259 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 POLG-202ENST00000442287 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 CCT6P3-201ENST00000419314 3702 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 RB1-201ENST00000267163 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 COL1A2-213ENST00000620463 4523 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 SLC4A7-203ENST00000425128 7970 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 RGS12-201ENST00000336727 4674 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 HPSE-201ENST00000311412 4615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 ARHGAP31-201ENST00000264245 9317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 WDR73-202ENST00000434634 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 PRPSAP1-206ENST00000446526 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 GUSBP11-206ENST00000455485 3816 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 IGHG4-202ENST00000641978 2597 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 PTPRK-204ENST00000368210 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 NCBP1-202ENST00000375147 5178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 MED6-201ENST00000256379 1995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms