Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 AC134312.2-201ENST00000563521 608 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRAMEF22A3QJZ6 PPCDC-206ENST00000564923 757 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRAMEF22A3QJZ6 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRAMEF22A3QJZ6 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRAMEF22A3QJZ6 HKR1-220ENST00000591259 734 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRAMEF22A3QJZ6 APOBEC3H-207ENST00000613996 465 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRAMEF22A3QJZ6 PFDN5-220ENST00000628881 231 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRAMEF22A3QJZ6 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRAMEF22A3QJZ6 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRAMEF22A3QJZ6 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRAMEF22A3QJZ6 METTL6-202ENST00000383790 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRAMEF22A3QJZ6 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRAMEF22A3QJZ6 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRAMEF22A3QJZ6 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRAMEF22A3QJZ6 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRAMEF22A3QJZ6 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRAMEF22A3QJZ6 ACTN1-205ENST00000538545 2813 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRAMEF22A3QJZ6 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRAMEF22A3QJZ6 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRAMEF22A3QJZ6 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PRAMEF22A3QJZ6 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PRAMEF22A3QJZ6 BTNL8-203ENST00000400707 1512 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRAMEF22A3QJZ6 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRAMEF22A3QJZ6 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRAMEF22A3QJZ6 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRAMEF22A3QJZ6 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRAMEF22A3QJZ6 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRAMEF22A3QJZ6 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRAMEF22A3QJZ6 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRAMEF22A3QJZ6 LPCAT4-209ENST00000617710 1719 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRAMEF22A3QJZ6 WDR46-231ENST00000374617 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRAMEF22A3QJZ6 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRAMEF22A3QJZ6 ENDOV-207ENST00000518907 2418 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRAMEF22A3QJZ6 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRAMEF22A3QJZ6 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRAMEF22A3QJZ6 G0S2-201ENST00000367029 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRAMEF22A3QJZ6 RPRD2-201ENST00000369067 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRAMEF22A3QJZ6 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRAMEF22A3QJZ6 AL353658.1-201ENST00000436263 789 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRAMEF22A3QJZ6 SUMF2-210ENST00000437307 947 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRAMEF22A3QJZ6 AC113391.2-201ENST00000512245 553 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRAMEF22A3QJZ6 SLC25A21-203ENST00000555449 1023 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRAMEF22A3QJZ6 SHBG-210ENST00000572262 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRAMEF22A3QJZ6 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRAMEF22A3QJZ6 AC011451.3-201ENST00000634951 582 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRAMEF22A3QJZ6 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRAMEF22A3QJZ6 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRAMEF22A3QJZ6 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRAMEF22A3QJZ6 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRAMEF22A3QJZ6 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PRAMEF22A3QJZ6 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRAMEF22A3QJZ6 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRAMEF22A3QJZ6 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRAMEF22A3QJZ6 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PRAMEF22A3QJZ6 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRAMEF22A3QJZ6 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRAMEF22A3QJZ6 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRAMEF22A3QJZ6 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRAMEF22A3QJZ6 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRAMEF22A3QJZ6 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRAMEF22A3QJZ6 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PRAMEF22A3QJZ6 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRAMEF22A3QJZ6 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRAMEF22A3QJZ6 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRAMEF22A3QJZ6 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRAMEF22A3QJZ6 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRAMEF22A3QJZ6 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRAMEF22A3QJZ6 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRAMEF22A3QJZ6 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRAMEF22A3QJZ6 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PRAMEF22A3QJZ6 POLR2G-201ENST00000301788 827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRAMEF22A3QJZ6 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRAMEF22A3QJZ6 TMSB4X-202ENST00000380635 767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRAMEF22A3QJZ6 WASIR1-201ENST00000399966 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRAMEF22A3QJZ6 OR2W2P-201ENST00000406313 909 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PRAMEF22A3QJZ6 HCG27-204ENST00000424675 895 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRAMEF22A3QJZ6 AC005722.1-201ENST00000431878 964 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PRAMEF22A3QJZ6 IGKV1D-43-201ENST00000468879 532 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRAMEF22A3QJZ6 LINC00173-201ENST00000470091 435 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRAMEF22A3QJZ6 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRAMEF22A3QJZ6 AC105390.1-201ENST00000511330 560 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRAMEF22A3QJZ6 POLR2J3-217ENST00000513438 546 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRAMEF22A3QJZ6 AC111149.2-202ENST00000518355 599 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRAMEF22A3QJZ6 PRB3-202ENST00000538488 1283 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRAMEF22A3QJZ6 AC005154.1-232ENST00000582549 556 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRAMEF22A3QJZ6 AC010632.2-201ENST00000588369 1224 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PRAMEF22A3QJZ6 APOC4-202ENST00000592954 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRAMEF22A3QJZ6 AL136982.5-201ENST00000605222 294 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PRAMEF22A3QJZ6 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRAMEF22A3QJZ6 AC126755.5-201ENST00000622756 267 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PRAMEF22A3QJZ6 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRAMEF22A3QJZ6 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRAMEF22A3QJZ6 SHANK2-202ENST00000357171 1373 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRAMEF22A3QJZ6 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRAMEF22A3QJZ6 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRAMEF22A3QJZ6 PAIP2-201ENST00000265192 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRAMEF22A3QJZ6 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PRAMEF22A3QJZ6 AC005906.2-205ENST00000640862 1522 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRAMEF22A3QJZ6 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRAMEF22A3QJZ6 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms