Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 RPF1-201ENST00000370654 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9Y3F1 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 CNBP-203ENST00000446936 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 CNBP-204ENST00000451728 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 HTR3D-201ENST00000334128 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 AC061965.1-201ENST00000560524 1465 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 CNMD-203ENST00000448904 1444 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 IFITM1-201ENST00000328221 844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 SFMBT2-202ENST00000379711 692 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 KRTAP4-12-201ENST00000394014 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 SNU13-204ENST00000402458 462 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 HNRNPA1P58-201ENST00000403629 610 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 IFITM1-202ENST00000408968 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 AC104961.1-201ENST00000427605 771 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 CLDN25-201ENST00000453129 754 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 AC128689.1-202ENST00000459861 827 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 RHOH-206ENST00000505618 1225 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 AC078852.1-201ENST00000515842 441 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 ETV4-208ENST00000586826 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 MECP2-213ENST00000622433 1071 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 AC106774.7-201ENST00000638408 597 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 AC106774.6-201ENST00000638483 597 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 AC233724.20-201ENST00000638842 597 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 AC233724.19-201ENST00000639969 597 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 AC106774.5-201ENST00000640558 597 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 AC233724.18-201ENST00000640803 597 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 AC233724.21-201ENST00000640846 597 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 PHTF2-204ENST00000415251 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 SNCAIP-206ENST00000414317 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 LHFPL1-201ENST00000371968 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 NIFK-AS1-203ENST00000419902 1316 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 FCRL6-202ENST00000339348 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 PDHB-201ENST00000302746 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 LILRB3-201ENST00000245620 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 TNNT2-207ENST00000367322 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 OLFML2B-202ENST00000367938 1153 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 PGAM1P11-201ENST00000416729 680 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 AP001596.1-201ENST00000429340 781 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 GNAT1-202ENST00000433068 1224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 GOLGA6L16P-201ENST00000441780 1299 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 SPRY4-AS1-203ENST00000443800 566 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 AC104212.2-201ENST00000478813 628 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 POLR3G-207ENST00000514483 682 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 PRSS55-203ENST00000522210 1005 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 CD44-224ENST00000526669 870 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 AC005845.1-201ENST00000539206 653 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 AC004801.1-201ENST00000549557 360 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 TMEM211-203ENST00000640159 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 AC139713.2-207ENST00000641556 1292 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 HEXA-206ENST00000566304 1795 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 PPHLN1-223ENST00000610488 1521 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9Y3F1 UBE2L5P-202ENST00000635918 1513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
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