Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPR3

SMG5, Protein SMG5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG5Q9UPR3 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SMG5Q9UPR3 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SMG5Q9UPR3 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SMG5Q9UPR3 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMG5Q9UPR3 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SMG5Q9UPR3 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SMG5Q9UPR3 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SMG5Q9UPR3 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SMG5Q9UPR3 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SMG5Q9UPR3 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SMG5Q9UPR3 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SMG5Q9UPR3 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SMG5Q9UPR3 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMG5Q9UPR3 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SMG5Q9UPR3 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SMG5Q9UPR3 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SMG5Q9UPR3 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SMG5Q9UPR3 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMG5Q9UPR3 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMG5Q9UPR3 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SMG5Q9UPR3 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMG5Q9UPR3 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMG5Q9UPR3 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SMG5Q9UPR3 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMG5Q9UPR3 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SMG5Q9UPR3 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMG5Q9UPR3 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMG5Q9UPR3 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMG5Q9UPR3 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMG5Q9UPR3 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SMG5Q9UPR3 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMG5Q9UPR3 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SMG5Q9UPR3 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SMG5Q9UPR3 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMG5Q9UPR3 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMG5Q9UPR3 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMG5Q9UPR3 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMG5Q9UPR3 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMG5Q9UPR3 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMG5Q9UPR3 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMG5Q9UPR3 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMG5Q9UPR3 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SMG5Q9UPR3 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SMG5Q9UPR3 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMG5Q9UPR3 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SMG5Q9UPR3 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SMG5Q9UPR3 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
SMG5Q9UPR3 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SMG5Q9UPR3 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMG5Q9UPR3 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SMG5Q9UPR3 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMG5Q9UPR3 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SMG5Q9UPR3 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SMG5Q9UPR3 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SMG5Q9UPR3 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SMG5Q9UPR3 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMG5Q9UPR3 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SMG5Q9UPR3 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMG5Q9UPR3 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SMG5Q9UPR3 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMG5Q9UPR3 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SMG5Q9UPR3 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMG5Q9UPR3 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMG5Q9UPR3 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SMG5Q9UPR3 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SMG5Q9UPR3 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMG5Q9UPR3 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMG5Q9UPR3 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMG5Q9UPR3 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMG5Q9UPR3 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMG5Q9UPR3 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SMG5Q9UPR3 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMG5Q9UPR3 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SMG5Q9UPR3 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SMG5Q9UPR3 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMG5Q9UPR3 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
SMG5Q9UPR3 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMG5Q9UPR3 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SMG5Q9UPR3 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SMG5Q9UPR3 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMG5Q9UPR3 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMG5Q9UPR3 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SMG5Q9UPR3 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMG5Q9UPR3 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SMG5Q9UPR3 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMG5Q9UPR3 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMG5Q9UPR3 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SMG5Q9UPR3 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMG5Q9UPR3 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMG5Q9UPR3 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMG5Q9UPR3 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMG5Q9UPR3 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMG5Q9UPR3 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SMG5Q9UPR3 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SMG5Q9UPR3 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMG5Q9UPR3 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SMG5Q9UPR3 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMG5Q9UPR3 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
SMG5Q9UPR3 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SMG5Q9UPR3 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms