Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB9

TFIP11, Tuftelin-interacting protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFIP11Q9UBB9 SGMS1-203ENST00000429490 3634 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 RAB15-201ENST00000267512 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 OPRL1-202ENST00000349451 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 AL772337.1-201ENST00000399186 2014 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 ASS1-203ENST00000372393 1548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 BHLHE40-AS1-204ENST00000620618 2355 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 OSBPL9-201ENST00000361556 2721 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 ABCF3-201ENST00000292808 2453 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 AP001999.1-201ENST00000513405 3684 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 KLHL32-206ENST00000544166 2864 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 SLC5A5-201ENST00000222248 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 SMYD4-201ENST00000305513 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 CAMKK2-204ENST00000392473 2967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 TIPARP-201ENST00000295924 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 AHCY-205ENST00000538132 2366 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 CYB5A-202ENST00000340533 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 AC004623.1-201ENST00000624592 2127 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 GRM5-AS1-201ENST00000526448 4821 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 APOBEC3D-202ENST00000427494 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 SUPT7L-203ENST00000405491 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 HSPA6-201ENST00000309758 2371 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 NFKB1-201ENST00000226574 4085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 CTCFL-208ENST00000432255 2955 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 PPP2R1B-204ENST00000426998 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
TFIP11Q9UBB9 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TFIP11Q9UBB9 XRCC6-202ENST00000360079 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TFIP11Q9UBB9 LINC00511-213ENST00000581549 2265 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TFIP11Q9UBB9 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TFIP11Q9UBB9 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TFIP11Q9UBB9 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TFIP11Q9UBB9 NCLN-201ENST00000246117 4005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TFIP11Q9UBB9 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TFIP11Q9UBB9 F2-205ENST00000530231 1849 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TFIP11Q9UBB9 SNCA-204ENST00000394989 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TFIP11Q9UBB9 CEACAM20-204ENST00000617951 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms