Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUT4

LRRN4, Leucine-rich repeat neuronal protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN4Q8WUT4 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 AC107308.1-201ENST00000615897 301 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 LINC00226-202ENST00000618204 1052 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 AL445209.1-201ENST00000607269 3491 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 AGAP12P-201ENST00000585227 2359 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 SNCAIP-222ENST00000542191 2729 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 AC103798.2-201ENST00000624292 632 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 CSF2RB-203ENST00000406230 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 SLC8A2-203ENST00000542837 3603 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LRRN4Q8WUT4 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.3 ms