Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVL6

P3H3, Prolyl 3-hydroxylase 3, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P3H3Q8IVL6 CPA5-206ENST00000474905 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
P3H3Q8IVL6 FBXO16-202ENST00000380254 1343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
P3H3Q8IVL6 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
P3H3Q8IVL6 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
P3H3Q8IVL6 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
P3H3Q8IVL6 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
P3H3Q8IVL6 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
P3H3Q8IVL6 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
P3H3Q8IVL6 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
P3H3Q8IVL6 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
P3H3Q8IVL6 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
P3H3Q8IVL6 OPN1SW-201ENST00000249389 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
P3H3Q8IVL6 PGAM1P11-201ENST00000416729 680 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
P3H3Q8IVL6 AC104961.1-201ENST00000427605 771 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
P3H3Q8IVL6 AL022332.1-202ENST00000432495 426 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
P3H3Q8IVL6 SEPHS2P1-201ENST00000511618 1162 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
P3H3Q8IVL6 ORAOV1-205ENST00000535657 709 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
P3H3Q8IVL6 BID-209ENST00000551952 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
P3H3Q8IVL6 HNRNPA1P5-201ENST00000558213 966 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
P3H3Q8IVL6 LINC02252-201ENST00000565706 487 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
P3H3Q8IVL6 AL078590.3-205ENST00000606039 465 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
P3H3Q8IVL6 MME-218ENST00000625667 363 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
P3H3Q8IVL6 AC106774.7-201ENST00000638408 597 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
P3H3Q8IVL6 AC106774.6-201ENST00000638483 597 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
P3H3Q8IVL6 AC233724.20-201ENST00000638842 597 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
P3H3Q8IVL6 AC233724.19-201ENST00000639969 597 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
P3H3Q8IVL6 AC106774.5-201ENST00000640558 597 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
P3H3Q8IVL6 AC233724.18-201ENST00000640803 597 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
P3H3Q8IVL6 AC233724.21-201ENST00000640846 597 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
P3H3Q8IVL6 EZH2-202ENST00000350995 2477 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
P3H3Q8IVL6 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
P3H3Q8IVL6 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
P3H3Q8IVL6 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
P3H3Q8IVL6 STAG1-206ENST00000480733 1304 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
P3H3Q8IVL6 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
P3H3Q8IVL6 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
P3H3Q8IVL6 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
P3H3Q8IVL6 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
P3H3Q8IVL6 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
P3H3Q8IVL6 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
P3H3Q8IVL6 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
P3H3Q8IVL6 GGA1-201ENST00000325180 2528 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
P3H3Q8IVL6 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
P3H3Q8IVL6 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
P3H3Q8IVL6 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
P3H3Q8IVL6 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
P3H3Q8IVL6 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
P3H3Q8IVL6 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
P3H3Q8IVL6 ZFP1-201ENST00000332307 1502 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
P3H3Q8IVL6 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
P3H3Q8IVL6 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
P3H3Q8IVL6 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
P3H3Q8IVL6 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
P3H3Q8IVL6 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
P3H3Q8IVL6 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
P3H3Q8IVL6 C11orf53-201ENST00000280325 1208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
P3H3Q8IVL6 BCL2L11-202ENST00000337565 720 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
P3H3Q8IVL6 NSMCE1-201ENST00000361439 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
P3H3Q8IVL6 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
P3H3Q8IVL6 S100A13-203ENST00000392623 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
P3H3Q8IVL6 COPS7B-204ENST00000409091 806 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
P3H3Q8IVL6 SEPT7-AS1-201ENST00000412856 587 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
P3H3Q8IVL6 IFNWP2-201ENST00000431203 580 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
P3H3Q8IVL6 RN7SL128P-201ENST00000467883 305 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
P3H3Q8IVL6 ZNF576-205ENST00000529930 830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
P3H3Q8IVL6 AC006547.3-201ENST00000600090 583 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
P3H3Q8IVL6 AQP7-213ENST00000624075 1270 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
P3H3Q8IVL6 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
P3H3Q8IVL6 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
P3H3Q8IVL6 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
P3H3Q8IVL6 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
P3H3Q8IVL6 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
P3H3Q8IVL6 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
P3H3Q8IVL6 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
P3H3Q8IVL6 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
P3H3Q8IVL6 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
P3H3Q8IVL6 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
P3H3Q8IVL6 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
P3H3Q8IVL6 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
P3H3Q8IVL6 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
P3H3Q8IVL6 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
P3H3Q8IVL6 HEXA-206ENST00000566304 1795 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
P3H3Q8IVL6 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
P3H3Q8IVL6 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
P3H3Q8IVL6 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
P3H3Q8IVL6 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
P3H3Q8IVL6 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
P3H3Q8IVL6 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
P3H3Q8IVL6 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
P3H3Q8IVL6 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
P3H3Q8IVL6 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
P3H3Q8IVL6 FADS1-206ENST00000460649 1559 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
P3H3Q8IVL6 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
P3H3Q8IVL6 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
P3H3Q8IVL6 DERL3-202ENST00000318109 860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
P3H3Q8IVL6 EPPIN-201ENST00000336443 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
P3H3Q8IVL6 CLCC1-202ENST00000348264 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
P3H3Q8IVL6 AC022080.1-201ENST00000366255 781 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
P3H3Q8IVL6 OLFML2B-202ENST00000367938 1153 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
P3H3Q8IVL6 PRELID3B-202ENST00000371033 943 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms