Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC174Q6PII3 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC174Q6PII3 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC174Q6PII3 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC174Q6PII3 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC174Q6PII3 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC174Q6PII3 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC174Q6PII3 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC174Q6PII3 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC174Q6PII3 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC174Q6PII3 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC174Q6PII3 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC174Q6PII3 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC174Q6PII3 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC174Q6PII3 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC174Q6PII3 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC174Q6PII3 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC174Q6PII3 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC174Q6PII3 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC174Q6PII3 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC174Q6PII3 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC174Q6PII3 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms