Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSL9

STRIP1, Striatin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRIP1Q5VSL9 SCAMP5-216ENST00000568081 710 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 AL627230.2-201ENST00000613254 655 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 FTSJ1-203ENST00000396894 1669 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 HTR3D-201ENST00000334128 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 GLIPR1L2-201ENST00000320460 1729 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 DDC-204ENST00000426377 1700 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 TMEM9B-202ENST00000525069 1433 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 AC062028.1-201ENST00000536743 1422 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 KCNK9-201ENST00000303015 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 HNRNPA1P58-201ENST00000403629 610 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 PGAM1P11-201ENST00000416729 680 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 GNAT1-202ENST00000433068 1224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 BX322557.2-201ENST00000445242 379 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 TBC1D3P6-201ENST00000505954 962 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 ZFP36-201ENST00000594045 690 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 AC113385.2-201ENST00000614465 762 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 AL139424.3-202ENST00000641619 917 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 SELENBP1-208ENST00000447402 1530 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 Z98885.3-201ENST00000624882 1757 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 KLK4-201ENST00000324041 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 OLFML2B-202ENST00000367938 1153 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 HLA-DRB5-201ENST00000374975 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 AL359853.1-202ENST00000415218 544 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 MED19-202ENST00000431606 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 GOLGA6L16P-201ENST00000441780 1299 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 AL445471.1-201ENST00000456316 820 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 IGHEP2-201ENST00000519308 1256 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 RMDN1-218ENST00000523911 950 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 C9orf135-205ENST00000527647 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 SLC25A3-215ENST00000551265 580 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 SEPT14P19-201ENST00000587432 336 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 PDHB-201ENST00000302746 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 PPHLN1-223ENST00000610488 1521 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 DNAJB13-201ENST00000339764 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
STRIP1Q5VSL9 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 260.5 ms