Protein–RNA interactions for Protein: Q07326

PIGF, Phosphatidylinositol-glycan biosynthesis class F protein, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIGFQ07326 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PIGFQ07326 TCF3-201ENST00000262965 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PIGFQ07326 STAG3-206ENST00000426455 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PIGFQ07326 SNCA-204ENST00000394989 3167 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PIGFQ07326 UNK-205ENST00000589666 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PIGFQ07326 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PIGFQ07326 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PIGFQ07326 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
PIGFQ07326 EPB41L1-202ENST00000338074 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PIGFQ07326 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PIGFQ07326 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PIGFQ07326 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PIGFQ07326 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PIGFQ07326 SYNPO-205ENST00000522122 5098 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PIGFQ07326 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PIGFQ07326 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PIGFQ07326 LEPROTL1-201ENST00000321250 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PIGFQ07326 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PIGFQ07326 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PIGFQ07326 POLD1-210ENST00000599857 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PIGFQ07326 FNTB-201ENST00000246166 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PIGFQ07326 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PIGFQ07326 COX6B2-210ENST00000593184 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PIGFQ07326 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PIGFQ07326 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PIGFQ07326 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PIGFQ07326 C17orf53-203ENST00000585683 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PIGFQ07326 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PIGFQ07326 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PIGFQ07326 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PIGFQ07326 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PIGFQ07326 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PIGFQ07326 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PIGFQ07326 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
PIGFQ07326 MKX-201ENST00000375790 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PIGFQ07326 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PIGFQ07326 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
PIGFQ07326 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PIGFQ07326 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PIGFQ07326 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PIGFQ07326 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PIGFQ07326 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PIGFQ07326 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PIGFQ07326 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PIGFQ07326 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
PIGFQ07326 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PIGFQ07326 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PIGFQ07326 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PIGFQ07326 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PIGFQ07326 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PIGFQ07326 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
PIGFQ07326 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PIGFQ07326 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
PIGFQ07326 AC004623.1-201ENST00000624592 2127 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
PIGFQ07326 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PIGFQ07326 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PIGFQ07326 CES1P1-201ENST00000421606 1704 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
PIGFQ07326 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PIGFQ07326 KCNMA1-291ENST00000640834 3664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PIGFQ07326 MYCBP-201ENST00000397572 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PIGFQ07326 BCL2L1-201ENST00000307677 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PIGFQ07326 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PIGFQ07326 GNAI2-203ENST00000422163 2407 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PIGFQ07326 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PIGFQ07326 RAB44-202ENST00000612677 4233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PIGFQ07326 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PIGFQ07326 SPTSSB-201ENST00000359175 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PIGFQ07326 RAB3D-201ENST00000222120 4273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PIGFQ07326 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PIGFQ07326 C8B-201ENST00000371237 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PIGFQ07326 MAP2K3-214ENST00000613338 2029 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PIGFQ07326 NCS1-201ENST00000372398 4991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PIGFQ07326 PLAT-201ENST00000220809 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PIGFQ07326 YY1AP1-208ENST00000361831 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PIGFQ07326 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PIGFQ07326 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PIGFQ07326 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PIGFQ07326 MSH6-214ENST00000616033 3429 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PIGFQ07326 PREX1-201ENST00000371941 6636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PIGFQ07326 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PIGFQ07326 AP1B1-202ENST00000357586 4176 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PIGFQ07326 AC144450.1-201ENST00000366424 1641 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PIGFQ07326 TMEM130-201ENST00000339375 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PIGFQ07326 MSH2-206ENST00000543555 3024 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PIGFQ07326 SPAST-201ENST00000315285 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PIGFQ07326 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PIGFQ07326 GOLGA2P5-201ENST00000266746 2395 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PIGFQ07326 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PIGFQ07326 POPDC2-201ENST00000264231 1679 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PIGFQ07326 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PIGFQ07326 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PIGFQ07326 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PIGFQ07326 TNPO2-218ENST00000592287 2914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PIGFQ07326 ALDH3A2-201ENST00000176643 3928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PIGFQ07326 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PIGFQ07326 ABCF3-201ENST00000292808 2453 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PIGFQ07326 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PIGFQ07326 RBM10-201ENST00000329236 3201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PIGFQ07326 PITX2-211ENST00000613094 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PIGFQ07326 AC027369.3-201ENST00000530465 3707 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms