Protein–RNA interactions for Protein: P54198

HIRA, Protein HIRA, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,017 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRAP54198 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIRAP54198 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIRAP54198 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIRAP54198 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIRAP54198 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIRAP54198 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIRAP54198 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIRAP54198 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIRAP54198 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIRAP54198 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIRAP54198 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIRAP54198 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIRAP54198 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIRAP54198 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIRAP54198 FLAD1-202ENST00000295530 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIRAP54198 CALML6-201ENST00000307786 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIRAP54198 TRPM3-205ENST00000361823 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIRAP54198 AIG1-203ENST00000367596 559 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIRAP54198 IL18BP-206ENST00000393707 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIRAP54198 TOMM5-203ENST00000401811 789 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIRAP54198 LINC01885-201ENST00000414300 609 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIRAP54198 AC231533.1-201ENST00000416061 925 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIRAP54198 SAPCD1-AS1-202ENST00000419679 461 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIRAP54198 FDPSP7-201ENST00000429043 1054 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HIRAP54198 ALKBH2-203ENST00000440112 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIRAP54198 CIDEC-205ENST00000443115 443 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIRAP54198 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HIRAP54198 TPT1P6-201ENST00000458298 514 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HIRAP54198 AC108724.1-201ENST00000481669 352 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HIRAP54198 AC112484.2-201ENST00000498297 1298 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIRAP54198 SMIM15-202ENST00000507416 584 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIRAP54198 C5orf63-203ENST00000509733 553 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIRAP54198 COQ10BP2-201ENST00000513804 724 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HIRAP54198 NKAPP1-204ENST00000555168 557 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIRAP54198 PAX6-237ENST00000638696 1203 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIRAP54198 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIRAP54198 GPR45-201ENST00000258456 1307 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIRAP54198 SFXN4-201ENST00000355697 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIRAP54198 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIRAP54198 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIRAP54198 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIRAP54198 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIRAP54198 LGALS4-201ENST00000307751 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIRAP54198 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIRAP54198 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIRAP54198 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIRAP54198 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIRAP54198 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIRAP54198 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HIRAP54198 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HIRAP54198 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HIRAP54198 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HIRAP54198 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HIRAP54198 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HIRAP54198 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HIRAP54198 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HIRAP54198 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HIRAP54198 MANEA-202ENST00000369293 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HIRAP54198 DKKL1P1-201ENST00000400550 698 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HIRAP54198 RIC3-205ENST00000425599 867 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HIRAP54198 HNRNPA1P10-201ENST00000444945 962 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HIRAP54198 TCEAL4-206ENST00000468024 1135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HIRAP54198 NAV2-AS2-201ENST00000533767 782 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HIRAP54198 AC105133.1-201ENST00000559749 742 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HIRAP54198 LINC01029-202ENST00000578833 366 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HIRAP54198 AP001462.1-201ENST00000594089 452 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HIRAP54198 AL513478.2-202ENST00000621949 835 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HIRAP54198 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HIRAP54198 Z98885.3-201ENST00000624882 1757 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HIRAP54198 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HIRAP54198 NEK3-210ENST00000620675 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HIRAP54198 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HIRAP54198 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HIRAP54198 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HIRAP54198 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HIRAP54198 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HIRAP54198 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HIRAP54198 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HIRAP54198 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HIRAP54198 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HIRAP54198 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HIRAP54198 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HIRAP54198 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HIRAP54198 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HIRAP54198 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HIRAP54198 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HIRAP54198 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HIRAP54198 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HIRAP54198 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HIRAP54198 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HIRAP54198 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HIRAP54198 RPAIN-202ENST00000381208 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HIRAP54198 HLF-202ENST00000430986 1385 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HIRAP54198 IFITM1-201ENST00000328221 844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HIRAP54198 GLRX2-202ENST00000367440 1131 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HIRAP54198 PMF1-203ENST00000368279 1019 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HIRAP54198 IFITM1-202ENST00000408968 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HIRAP54198 AC027612.2-201ENST00000436174 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HIRAP54198 CCND3P1-201ENST00000438347 580 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HIRAP54198 AC092910.2-201ENST00000491262 348 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.4 ms