Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ARID4AP29374 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARID4AP29374 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ARID4AP29374 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARID4AP29374 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARID4AP29374 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARID4AP29374 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARID4AP29374 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARID4AP29374 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARID4AP29374 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARID4AP29374 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARID4AP29374 AL663074.1-201ENST00000436642 299 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARID4AP29374 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARID4AP29374 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARID4AP29374 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ARID4AP29374 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARID4AP29374 AC011444.1-201ENST00000587836 639 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARID4AP29374 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARID4AP29374 AC091769.1-201ENST00000619576 568 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ARID4AP29374 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARID4AP29374 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARID4AP29374 BIN3-202ENST00000399977 1340 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARID4AP29374 PDXDC2P-206ENST00000534700 1315 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ARID4AP29374 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARID4AP29374 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARID4AP29374 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARID4AP29374 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARID4AP29374 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARID4AP29374 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARID4AP29374 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARID4AP29374 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARID4AP29374 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARID4AP29374 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARID4AP29374 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARID4AP29374 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ARID4AP29374 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARID4AP29374 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARID4AP29374 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ARID4AP29374 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ARID4AP29374 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ARID4AP29374 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ARID4AP29374 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARID4AP29374 ALDOA-204ENST00000412304 1603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARID4AP29374 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ARID4AP29374 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ARID4AP29374 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARID4AP29374 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARID4AP29374 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARID4AP29374 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARID4AP29374 RPL18A-205ENST00000600147 1391 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARID4AP29374 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARID4AP29374 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARID4AP29374 DACT3-AS1-201ENST00000500689 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARID4AP29374 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARID4AP29374 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARID4AP29374 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARID4AP29374 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARID4AP29374 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARID4AP29374 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARID4AP29374 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ARID4AP29374 AC092573.1-201ENST00000433054 884 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ARID4AP29374 ALKBH2-203ENST00000440112 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARID4AP29374 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARID4AP29374 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARID4AP29374 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARID4AP29374 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARID4AP29374 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARID4AP29374 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ARID4AP29374 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARID4AP29374 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARID4AP29374 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ARID4AP29374 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARID4AP29374 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARID4AP29374 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARID4AP29374 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARID4AP29374 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARID4AP29374 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARID4AP29374 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARID4AP29374 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARID4AP29374 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARID4AP29374 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARID4AP29374 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARID4AP29374 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARID4AP29374 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARID4AP29374 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARID4AP29374 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARID4AP29374 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARID4AP29374 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARID4AP29374 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARID4AP29374 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARID4AP29374 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARID4AP29374 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARID4AP29374 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARID4AP29374 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARID4AP29374 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARID4AP29374 PAX6-264ENST00000640125 1375 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARID4AP29374 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARID4AP29374 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARID4AP29374 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARID4AP29374 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.2 ms