Protein–RNA interactions for Protein: P11532

DMD, Dystrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMDP11532 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
DMDP11532 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
DMDP11532 AP000437.1-201ENST00000624057 2085 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
DMDP11532 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
DMDP11532 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
DMDP11532 SLC25A3-202ENST00000228318 1678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
DMDP11532 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
DMDP11532 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
DMDP11532 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
DMDP11532 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
DMDP11532 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
DMDP11532 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
DMDP11532 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
DMDP11532 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
DMDP11532 MT-ND6-201ENST00000361681 525 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
DMDP11532 AC096677.3-201ENST00000413162 387 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
DMDP11532 POU5F1-202ENST00000441888 1055 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
DMDP11532 SMCO4-202ENST00000525141 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
DMDP11532 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
DMDP11532 GMPR2-205ENST00000456667 1484 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
DMDP11532 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DMDP11532 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DMDP11532 SIGLEC17P-204ENST00000618545 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DMDP11532 DNAJB6-204ENST00000429029 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DMDP11532 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DMDP11532 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
DMDP11532 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
DMDP11532 AC069421.1-201ENST00000447462 323 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
DMDP11532 RASGRF2-AS1-202ENST00000505694 535 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
DMDP11532 RAB11B-205ENST00000601897 577 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
DMDP11532 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DMDP11532 MAFTRR-201ENST00000562921 1859 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
DMDP11532 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DMDP11532 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
DMDP11532 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DMDP11532 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
DMDP11532 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DMDP11532 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DMDP11532 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DMDP11532 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
DMDP11532 GAPDH-204ENST00000396859 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DMDP11532 AL121994.1-201ENST00000413189 402 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
DMDP11532 AP000281.2-201ENST00000427911 384 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
DMDP11532 PARVG-208ENST00000466375 820 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
DMDP11532 EEF1GP2-201ENST00000509352 1243 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
DMDP11532 AP003168.2-201ENST00000531215 471 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
DMDP11532 HAX1-211ENST00000532105 771 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
DMDP11532 TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 562 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
DMDP11532 AC009779.7-201ENST00000609031 469 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
DMDP11532 LINC02498-201ENST00000635390 1065 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
DMDP11532 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
DMDP11532 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DMDP11532 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
DMDP11532 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
DMDP11532 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DMDP11532 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
DMDP11532 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
DMDP11532 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
DMDP11532 CALU-202ENST00000449187 2438 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DMDP11532 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
DMDP11532 RBP1-201ENST00000232219 898 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DMDP11532 MAL-204ENST00000354078 831 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DMDP11532 NPPA-202ENST00000376480 855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DMDP11532 INMT-202ENST00000409539 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DMDP11532 AL512422.2-201ENST00000426453 551 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
DMDP11532 ROPN1L-AS1-201ENST00000513037 189 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
DMDP11532 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
DMDP11532 MXRA7-204ENST00000585519 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
DMDP11532 NPPA-203ENST00000610706 849 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
DMDP11532 RBP1-206ENST00000617459 667 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
DMDP11532 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DMDP11532 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
DMDP11532 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
DMDP11532 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
DMDP11532 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
DMDP11532 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
DMDP11532 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
DMDP11532 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
DMDP11532 PEX11A-204ENST00000561224 529 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
DMDP11532 AL031058.1-201ENST00000561592 888 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
DMDP11532 AC006511.4-201ENST00000631571 561 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
DMDP11532 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
DMDP11532 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
DMDP11532 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
DMDP11532 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
DMDP11532 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
DMDP11532 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
DMDP11532 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
DMDP11532 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
DMDP11532 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
DMDP11532 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
DMDP11532 TIMM10-201ENST00000257245 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
DMDP11532 AL391903.1-201ENST00000407513 365 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
DMDP11532 MIR4326-201ENST00000582203 59 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
DMDP11532 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
DMDP11532 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
DMDP11532 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
DMDP11532 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
DMDP11532 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
DMDP11532 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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