Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 RRAGA-201ENST00000380527 1589 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 MARCH9-202ENST00000548358 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 MT1H-201ENST00000332374 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 NSMCE1-201ENST00000361439 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 PITHD1-202ENST00000374524 1292 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 ACTBP14-201ENST00000411655 1089 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 AC147651.3-201ENST00000429872 731 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 AC008443.1-202ENST00000506340 687 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 POLR3G-207ENST00000514483 682 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 AC004801.1-201ENST00000549557 360 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 AC007298.2-201ENST00000551849 862 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 AC009055.1-201ENST00000562656 781 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 AC079414.2-201ENST00000567157 1104 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 AC023389.1-201ENST00000577846 576 ntTSL 4 BASIC14.18□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 HIST2H4A-201ENST00000578186 583 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 ZNF571-AS1-204ENST00000587121 822 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 OR2T11-201ENST00000625105 1072 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 C1orf87-202ENST00000450089 1307 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.17□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 TMSB4X-202ENST00000380635 767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 KRTAP2-3-201ENST00000391418 875 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 AL137244.1-201ENST00000422931 865 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 AL022332.1-202ENST00000432495 426 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 AL137026.2-201ENST00000437014 841 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 TBC1D3P6-201ENST00000505954 962 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 VEGFA-219ENST00000518824 606 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 FXYD6-208ENST00000529335 708 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 BMF-206ENST00000558774 671 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 MKRN3-202ENST00000564592 629 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 AL031705.1-201ENST00000566922 682 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 AL049840.2-201ENST00000602722 535 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 NEK4P3-201ENST00000604859 544 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 INSC-205ENST00000525218 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 SNAPC2-206ENST00000597584 1413 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 CACNA1A-211ENST00000592864 1623 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
FOXQ1Q9C009 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.3 ms