Protein–RNA interactions for Protein: Q6P435

Putative uncharacterized SMG1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6P435 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q6P435 AC003986.1-201ENST00000452700 1526 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q6P435 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q6P435 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q6P435 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Q6P435 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q6P435 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q6P435 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q6P435 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q6P435 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q6P435 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Q6P435 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q6P435 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Q6P435 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q6P435 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q6P435 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q6P435 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q6P435 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Q6P435 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Q6P435 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q6P435 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q6P435 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Q6P435 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Q6P435 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q6P435 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q6P435 ZSCAN16-AS1-201ENST00000600652 2163 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q6P435 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q6P435 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q6P435 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q6P435 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q6P435 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q6P435 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Q6P435 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q6P435 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q6P435 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q6P435 PPT1-203ENST00000433473 2267 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q6P435 AL359845.1-201ENST00000458202 1648 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Q6P435 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q6P435 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q6P435 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q6P435 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q6P435 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Q6P435 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q6P435 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q6P435 TMEM40-205ENST00000435575 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q6P435 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q6P435 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q6P435 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q6P435 FAM230C-201ENST00000623511 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q6P435 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q6P435 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q6P435 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q6P435 LIMK1-208ENST00000538333 2170 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q6P435 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q6P435 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q6P435 LINC01285-204ENST00000634601 1947 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q6P435 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q6P435 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q6P435 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q6P435 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q6P435 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q6P435 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q6P435 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q6P435 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q6P435 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q6P435 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q6P435 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q6P435 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q6P435 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q6P435 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q6P435 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q6P435 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q6P435 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q6P435 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q6P435 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q6P435 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q6P435 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q6P435 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q6P435 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q6P435 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Q6P435 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q6P435 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Q6P435 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q6P435 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q6P435 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q6P435 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Q6P435 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q6P435 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q6P435 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q6P435 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q6P435 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Q6P435 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q6P435 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q6P435 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q6P435 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q6P435 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q6P435 CXorf40A-212ENST00000514208 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q6P435 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q6P435 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q6P435 ARFIP1-203ENST00000405727 1601 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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