Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 ITGB2-201ENST00000302347 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC10.92□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 FUT8-202ENST00000358307 2664 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 IL21R-204ENST00000564089 3009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 BUB1B-PAK6-201ENST00000441369 2767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 CD99L2-205ENST00000437787 3493 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
FHL3Q13643 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms