Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SPIBQ01892 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SPIBQ01892 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SPIBQ01892 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SPIBQ01892 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
SPIBQ01892 MICAL1-202ENST00000358807 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SPIBQ01892 ADGRG6-204ENST00000367609 6887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SPIBQ01892 CRISPLD2-209ENST00000567845 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SPIBQ01892 CNP-202ENST00000393892 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SPIBQ01892 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SPIBQ01892 AP1B1-202ENST00000357586 4176 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SPIBQ01892 KLHL32-206ENST00000544166 2864 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SPIBQ01892 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SPIBQ01892 GTF2IRD2-201ENST00000451013 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SPIBQ01892 LSM14A-203ENST00000544216 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SPIBQ01892 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SPIBQ01892 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SPIBQ01892 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SPIBQ01892 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SPIBQ01892 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SPIBQ01892 SUGP2-203ENST00000452918 6176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SPIBQ01892 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SPIBQ01892 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SPIBQ01892 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SPIBQ01892 PER3-201ENST00000361923 6203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SPIBQ01892 NXF1-201ENST00000294172 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SPIBQ01892 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SPIBQ01892 C15orf39-202ENST00000394987 4430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SPIBQ01892 ADAM12-202ENST00000368679 7938 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SPIBQ01892 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SPIBQ01892 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SPIBQ01892 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SPIBQ01892 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SPIBQ01892 PAAF1-201ENST00000310571 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SPIBQ01892 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SPIBQ01892 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SPIBQ01892 PCDHB18P-202ENST00000526308 3197 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
SPIBQ01892 USF1-202ENST00000368020 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SPIBQ01892 UGGT2-201ENST00000376712 2240 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SPIBQ01892 AC007663.2-201ENST00000506039 2228 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SPIBQ01892 NPHP3-ACAD11-201ENST00000471702 7784 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SPIBQ01892 TRAK1-201ENST00000327628 5293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SPIBQ01892 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SPIBQ01892 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SPIBQ01892 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SPIBQ01892 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SPIBQ01892 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SPIBQ01892 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SPIBQ01892 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SPIBQ01892 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SPIBQ01892 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SPIBQ01892 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SPIBQ01892 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SPIBQ01892 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
SPIBQ01892 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
SPIBQ01892 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
SPIBQ01892 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SPIBQ01892 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SPIBQ01892 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
SPIBQ01892 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SPIBQ01892 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SPIBQ01892 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SPIBQ01892 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SPIBQ01892 SLC5A5-201ENST00000222248 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SPIBQ01892 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SPIBQ01892 XIRP1-203ENST00000421646 2596 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SPIBQ01892 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SPIBQ01892 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SPIBQ01892 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SPIBQ01892 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SPIBQ01892 FOXP3-204ENST00000455775 2448 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SPIBQ01892 NISCH-207ENST00000479054 5173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SPIBQ01892 ACTR3-201ENST00000263238 6718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SPIBQ01892 SPOCK2-201ENST00000317376 5328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SPIBQ01892 WARS2-201ENST00000235521 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SPIBQ01892 ACTN1-205ENST00000538545 2813 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SPIBQ01892 CACNA1C-231ENST00000616390 2833 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SPIBQ01892 DDX54-202ENST00000314045 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPIBQ01892 BIRC2-208ENST00000532672 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPIBQ01892 GDAP1L1-208ENST00000617075 2645 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPIBQ01892 XPOT-201ENST00000332707 6414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPIBQ01892 NCAPG-201ENST00000251496 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPIBQ01892 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPIBQ01892 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPIBQ01892 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPIBQ01892 FUT1-201ENST00000310160 4246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPIBQ01892 NFKBIZ-202ENST00000326172 3923 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPIBQ01892 ENDOV-207ENST00000518907 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPIBQ01892 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPIBQ01892 PDCD6IPP2-206ENST00000566178 3351 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPIBQ01892 NIN-206ENST00000453196 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPIBQ01892 MADD-203ENST00000349238 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPIBQ01892 URGCP-207ENST00000453200 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPIBQ01892 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPIBQ01892 TAPBP-234ENST00000434618 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPIBQ01892 PRR12-201ENST00000418929 6955 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPIBQ01892 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPIBQ01892 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPIBQ01892 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SPIBQ01892 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms