Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 GMPPB-203ENST00000480687 6108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
ERVS71-1P61550 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms