Protein–RNA interactions for Protein: P32455

GBP1, Guanylate-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP1P32455 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBP1P32455 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBP1P32455 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBP1P32455 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBP1P32455 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBP1P32455 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBP1P32455 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBP1P32455 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GBP1P32455 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBP1P32455 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBP1P32455 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBP1P32455 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBP1P32455 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GBP1P32455 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBP1P32455 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBP1P32455 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBP1P32455 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBP1P32455 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GBP1P32455 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GBP1P32455 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBP1P32455 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GBP1P32455 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBP1P32455 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBP1P32455 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBP1P32455 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBP1P32455 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBP1P32455 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBP1P32455 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBP1P32455 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBP1P32455 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBP1P32455 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBP1P32455 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBP1P32455 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBP1P32455 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBP1P32455 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBP1P32455 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBP1P32455 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBP1P32455 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBP1P32455 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBP1P32455 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBP1P32455 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBP1P32455 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBP1P32455 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBP1P32455 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GBP1P32455 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBP1P32455 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBP1P32455 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBP1P32455 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBP1P32455 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBP1P32455 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBP1P32455 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBP1P32455 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GBP1P32455 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBP1P32455 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GBP1P32455 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBP1P32455 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBP1P32455 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBP1P32455 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBP1P32455 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBP1P32455 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBP1P32455 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBP1P32455 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBP1P32455 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBP1P32455 CLCN6-201ENST00000312413 5631 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBP1P32455 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBP1P32455 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBP1P32455 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GBP1P32455 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GBP1P32455 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GBP1P32455 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GBP1P32455 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GBP1P32455 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GBP1P32455 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GBP1P32455 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GBP1P32455 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GBP1P32455 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GBP1P32455 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GBP1P32455 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GBP1P32455 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GBP1P32455 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GBP1P32455 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GBP1P32455 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GBP1P32455 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GBP1P32455 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GBP1P32455 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GBP1P32455 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GBP1P32455 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GBP1P32455 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GBP1P32455 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GBP1P32455 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GBP1P32455 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GBP1P32455 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GBP1P32455 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GBP1P32455 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GBP1P32455 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GBP1P32455 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GBP1P32455 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GBP1P32455 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GBP1P32455 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GBP1P32455 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms