Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 ARID4A-202ENST00000355431 5891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TSPOP30536 CARHSP1-202ENST00000396593 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TSPOP30536 CSNK1G3-201ENST00000345990 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TSPOP30536 FHOD3-206ENST00000590592 4869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TSPOP30536 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TSPOP30536 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
TSPOP30536 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TSPOP30536 CACNA1G-214ENST00000505165 6633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TSPOP30536 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
TSPOP30536 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TSPOP30536 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TSPOP30536 INTS6-201ENST00000311234 3662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TSPOP30536 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
TSPOP30536 SLC26A6-207ENST00000420764 2630 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TSPOP30536 MATN1-AS1-201ENST00000414532 3925 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
TSPOP30536 TRPM5-203ENST00000533060 3562 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TSPOP30536 PRKN-205ENST00000366897 2877 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TSPOP30536 C1orf167-202ENST00000433342 4545 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
TSPOP30536 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
TSPOP30536 CXCR5-201ENST00000292174 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TSPOP30536 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TSPOP30536 FAM187A-201ENST00000331733 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TSPOP30536 CCDC103-204ENST00000417826 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TSPOP30536 AC241585.2-201ENST00000578899 2307 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TSPOP30536 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
TSPOP30536 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TSPOP30536 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
TSPOP30536 NEXN-201ENST00000330010 3195 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
TSPOP30536 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TSPOP30536 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
TSPOP30536 SFMBT2-204ENST00000397167 8024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
TSPOP30536 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TSPOP30536 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TSPOP30536 C10orf90-202ENST00000356858 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
TSPOP30536 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TSPOP30536 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
TSPOP30536 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
TSPOP30536 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
TSPOP30536 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
TSPOP30536 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
TSPOP30536 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TSPOP30536 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TSPOP30536 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TSPOP30536 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TSPOP30536 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
TSPOP30536 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
TSPOP30536 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
TSPOP30536 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
TSPOP30536 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TSPOP30536 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TSPOP30536 RBM10-201ENST00000329236 3201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TSPOP30536 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TSPOP30536 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TSPOP30536 TESMIN-204ENST00000443940 3495 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
TSPOP30536 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
TSPOP30536 TBX3-202ENST00000349155 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TSPOP30536 KIF12-201ENST00000374118 2001 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TSPOP30536 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
TSPOP30536 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TSPOP30536 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TSPOP30536 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TSPOP30536 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
TSPOP30536 GRIPAP1-207ENST00000593475 2908 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
TSPOP30536 C15orf39-202ENST00000394987 4430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TSPOP30536 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
TSPOP30536 GALNT16-201ENST00000337827 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TSPOP30536 ATG7-201ENST00000354449 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TSPOP30536 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
TSPOP30536 SH3TC1-201ENST00000245105 4226 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
TSPOP30536 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
TSPOP30536 PGGHG-204ENST00000409655 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TSPOP30536 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
TSPOP30536 TRMT1L-201ENST00000367506 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TSPOP30536 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
TSPOP30536 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
TSPOP30536 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
TSPOP30536 NTNG1-206ENST00000370071 3149 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
TSPOP30536 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TSPOP30536 DAB2IP-202ENST00000309989 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TSPOP30536 CENPL-202ENST00000356198 2357 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TSPOP30536 ZNF318-201ENST00000361428 8006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TSPOP30536 POTEE-201ENST00000356920 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TSPOP30536 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TSPOP30536 KCTD9-201ENST00000221200 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TSPOP30536 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TSPOP30536 EOGT-202ENST00000383701 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TSPOP30536 ACSM2B-201ENST00000329697 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TSPOP30536 ICOSLG-202ENST00000400377 2907 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
TSPOP30536 C19orf12-209ENST00000623113 4242 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
TSPOP30536 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
TSPOP30536 PCDHB17P-202ENST00000623466 3066 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
TSPOP30536 CDH11-201ENST00000268603 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TSPOP30536 C6orf62-202ENST00000378119 4134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TSPOP30536 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
TSPOP30536 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TSPOP30536 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TSPOP30536 FAM156A-208ENST00000615092 2098 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
TSPOP30536 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
TSPOP30536 NIN-206ENST00000453196 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
TSPOP30536 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms