Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 CTSV-201ENST00000259470 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 IMMT-212ENST00000620815 1520 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 RNF34-211ENST00000613529 1449 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 FKBP4P8-201ENST00000610931 1369 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 KCNIP1-210ENST00000636734 1613 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 VCX3A-202ENST00000398729 808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 KRTAP10-5-201ENST00000400372 1150 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 OR2W2P-201ENST00000406313 909 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 COPS7B-204ENST00000409091 806 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 AP000244.1-201ENST00000424582 201 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 FAM27E5-201ENST00000426869 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 FAM3D-AS1-201ENST00000464125 821 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 AC092903.1-201ENST00000466506 262 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 MUSTN1-202ENST00000486659 622 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 HNRNPA1P56-201ENST00000505767 954 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 AC109479.3-201ENST00000520163 360 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 UBR5-AS1-202ENST00000520820 800 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 TPP1-209ENST00000528657 578 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 CR383656.13-201ENST00000550928 563 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 AL512310.10-201ENST00000555580 563 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 AL078590.3-205ENST00000606039 465 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 OSMR-AS1-204ENST00000636516 850 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 BBS1-203ENST00000455748 1552 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 WDR46-231ENST00000374617 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 ZNF436-AS1-201ENST00000335648 2547 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 PCK2-208ENST00000559250 1804 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 CDKN2C-202ENST00000371761 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 GEMIN8P4-201ENST00000380526 729 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 FAM21EP-201ENST00000417804 985 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 AL096772.1-201ENST00000451135 781 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 LRRC75A-AS1-214ENST00000487066 763 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 AL928742.1-201ENST00000497397 548 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 AC090152.1-203ENST00000517898 1106 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 C10orf113-201ENST00000529198 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 LINC02252-201ENST00000565706 487 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 NAV1-210ENST00000593583 726 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 DGAT2L7P-201ENST00000602462 744 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 CCL3L3-203ENST00000619989 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 LINC01002-234ENST00000633808 848 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms