Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1E9PL57 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.4 ms