Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS6

SYNPO2, Synaptopodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNPO2Q9UMS6 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SYNPO2Q9UMS6 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SYNPO2Q9UMS6 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SYNPO2Q9UMS6 UBBP4-202ENST00000584755 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SYNPO2Q9UMS6 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SYNPO2Q9UMS6 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SYNPO2Q9UMS6 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SYNPO2Q9UMS6 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SYNPO2Q9UMS6 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SYNPO2Q9UMS6 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SYNPO2Q9UMS6 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SYNPO2Q9UMS6 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SYNPO2Q9UMS6 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SYNPO2Q9UMS6 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SYNPO2Q9UMS6 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SYNPO2Q9UMS6 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SYNPO2Q9UMS6 CNBP-203ENST00000446936 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SYNPO2Q9UMS6 CNBP-204ENST00000451728 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SYNPO2Q9UMS6 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SYNPO2Q9UMS6 MDS2-201ENST00000374555 1029 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SYNPO2Q9UMS6 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SYNPO2Q9UMS6 AL022332.1-202ENST00000432495 426 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SYNPO2Q9UMS6 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SYNPO2Q9UMS6 LINC02063-201ENST00000503415 566 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SYNPO2Q9UMS6 BID-209ENST00000551952 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SYNPO2Q9UMS6 CES1P2-201ENST00000566467 1242 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SYNPO2Q9UMS6 AC008982.2-201ENST00000600473 493 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SYNPO2Q9UMS6 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SYNPO2Q9UMS6 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SYNPO2Q9UMS6 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SYNPO2Q9UMS6 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SYNPO2Q9UMS6 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SYNPO2Q9UMS6 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SYNPO2Q9UMS6 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SYNPO2Q9UMS6 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SYNPO2Q9UMS6 AL356753.1-201ENST00000427035 2018 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SYNPO2Q9UMS6 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SYNPO2Q9UMS6 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SYNPO2Q9UMS6 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYNPO2Q9UMS6 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYNPO2Q9UMS6 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SYNPO2Q9UMS6 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYNPO2Q9UMS6 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYNPO2Q9UMS6 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYNPO2Q9UMS6 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYNPO2Q9UMS6 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYNPO2Q9UMS6 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYNPO2Q9UMS6 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYNPO2Q9UMS6 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYNPO2Q9UMS6 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYNPO2Q9UMS6 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYNPO2Q9UMS6 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYNPO2Q9UMS6 ID2-AS1-201ENST00000412712 953 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYNPO2Q9UMS6 AC156455.1-203ENST00000423999 893 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYNPO2Q9UMS6 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYNPO2Q9UMS6 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYNPO2Q9UMS6 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYNPO2Q9UMS6 C21orf62-204ENST00000490358 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYNPO2Q9UMS6 LINC01485-202ENST00000520324 566 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYNPO2Q9UMS6 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYNPO2Q9UMS6 MT2A-202ENST00000561491 581 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYNPO2Q9UMS6 AC005777.1-201ENST00000588332 187 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SYNPO2Q9UMS6 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYNPO2Q9UMS6 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYNPO2Q9UMS6 AL137793.2-201ENST00000632635 659 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYNPO2Q9UMS6 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYNPO2Q9UMS6 AF013593.1-201ENST00000458074 1487 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SYNPO2Q9UMS6 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYNPO2Q9UMS6 Z98885.2-201ENST00000565177 1567 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYNPO2Q9UMS6 NRADDP-202ENST00000641269 1585 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SYNPO2Q9UMS6 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYNPO2Q9UMS6 LHFPL1-201ENST00000371968 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYNPO2Q9UMS6 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYNPO2Q9UMS6 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYNPO2Q9UMS6 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYNPO2Q9UMS6 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYNPO2Q9UMS6 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYNPO2Q9UMS6 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYNPO2Q9UMS6 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYNPO2Q9UMS6 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYNPO2Q9UMS6 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYNPO2Q9UMS6 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYNPO2Q9UMS6 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYNPO2Q9UMS6 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYNPO2Q9UMS6 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYNPO2Q9UMS6 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYNPO2Q9UMS6 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYNPO2Q9UMS6 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYNPO2Q9UMS6 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYNPO2Q9UMS6 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYNPO2Q9UMS6 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYNPO2Q9UMS6 CCNB2-201ENST00000288207 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYNPO2Q9UMS6 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYNPO2Q9UMS6 EPPIN-201ENST00000336443 1217 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYNPO2Q9UMS6 AP001628.2-201ENST00000420273 784 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYNPO2Q9UMS6 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SYNPO2Q9UMS6 AC008026.2-201ENST00000495438 348 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SYNPO2Q9UMS6 NAV2-AS2-201ENST00000533767 782 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYNPO2Q9UMS6 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYNPO2Q9UMS6 MIR3940-201ENST00000579148 102 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms