Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV7

BCO2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCO2Q9BYV7 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 AC005498.2-204ENST00000590613 413 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BCO2Q9BYV7 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.8 ms