Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
GABARAPL3Q9BY60 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GABARAPL3Q9BY60 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GABARAPL3Q9BY60 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GABARAPL3Q9BY60 CTNNB1-202ENST00000396183 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GABARAPL3Q9BY60 PDHA1-212ENST00000540249 3277 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
GABARAPL3Q9BY60 HJURP-207ENST00000441687 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
GABARAPL3Q9BY60 NF1-204ENST00000431387 2889 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GABARAPL3Q9BY60 SYBU-217ENST00000528331 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GABARAPL3Q9BY60 XRCC6-202ENST00000360079 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GABARAPL3Q9BY60 FAM189A2-204ENST00000455972 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
GABARAPL3Q9BY60 ALDH7A1-234ENST00000637782 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
GABARAPL3Q9BY60 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC13□□□□□ -0.33
GABARAPL3Q9BY60 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GABARAPL3Q9BY60 SPAG8-202ENST00000396638 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GABARAPL3Q9BY60 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
GABARAPL3Q9BY60 AC003986.1-201ENST00000452700 1526 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GABARAPL3Q9BY60 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
GABARAPL3Q9BY60 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC13□□□□□ -0.33
GABARAPL3Q9BY60 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GABARAPL3Q9BY60 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GABARAPL3Q9BY60 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GABARAPL3Q9BY60 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GABARAPL3Q9BY60 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
GABARAPL3Q9BY60 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GABARAPL3Q9BY60 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
GABARAPL3Q9BY60 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC13□□□□□ -0.33
GABARAPL3Q9BY60 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GABARAPL3Q9BY60 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
GABARAPL3Q9BY60 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
GABARAPL3Q9BY60 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
GABARAPL3Q9BY60 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
GABARAPL3Q9BY60 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GABARAPL3Q9BY60 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
GABARAPL3Q9BY60 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
GABARAPL3Q9BY60 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
GABARAPL3Q9BY60 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GABARAPL3Q9BY60 PBXIP1-203ENST00000368465 3144 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
GABARAPL3Q9BY60 NCS1-201ENST00000372398 4991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GABARAPL3Q9BY60 DYNC1I1-201ENST00000324972 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GABARAPL3Q9BY60 EBF3-201ENST00000355311 2993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
GABARAPL3Q9BY60 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
GABARAPL3Q9BY60 FUT8-202ENST00000358307 2664 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GABARAPL3Q9BY60 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GABARAPL3Q9BY60 MUC20-203ENST00000436408 2463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
GABARAPL3Q9BY60 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GABARAPL3Q9BY60 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GABARAPL3Q9BY60 DAB2IP-202ENST00000309989 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GABARAPL3Q9BY60 FOXM1-210ENST00000627656 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GABARAPL3Q9BY60 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GABARAPL3Q9BY60 NGLY1-205ENST00000417874 2062 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
GABARAPL3Q9BY60 TOLLIP-203ENST00000525159 3429 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
GABARAPL3Q9BY60 C2-209ENST00000452323 1999 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
GABARAPL3Q9BY60 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GABARAPL3Q9BY60 DRG2-202ENST00000395726 1897 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
GABARAPL3Q9BY60 AC004846.1-201ENST00000554614 3050 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GABARAPL3Q9BY60 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GABARAPL3Q9BY60 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GABARAPL3Q9BY60 AC004147.4-201ENST00000636421 1844 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
GABARAPL3Q9BY60 CATSPERE-202ENST00000366533 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GABARAPL3Q9BY60 CDIP1-201ENST00000399599 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GABARAPL3Q9BY60 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
GABARAPL3Q9BY60 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GABARAPL3Q9BY60 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
GABARAPL3Q9BY60 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
GABARAPL3Q9BY60 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GABARAPL3Q9BY60 HPX-201ENST00000265983 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GABARAPL3Q9BY60 DNAJC14-202ENST00000317287 2774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
GABARAPL3Q9BY60 RSPO2-202ENST00000517781 2748 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GABARAPL3Q9BY60 Z98885.2-201ENST00000565177 1567 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
GABARAPL3Q9BY60 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GABARAPL3Q9BY60 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
GABARAPL3Q9BY60 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GABARAPL3Q9BY60 NPAS4-201ENST00000311034 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GABARAPL3Q9BY60 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GABARAPL3Q9BY60 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
GABARAPL3Q9BY60 KDM2B-215ENST00000542973 3170 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
GABARAPL3Q9BY60 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
GABARAPL3Q9BY60 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GABARAPL3Q9BY60 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GABARAPL3Q9BY60 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GABARAPL3Q9BY60 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
GABARAPL3Q9BY60 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
GABARAPL3Q9BY60 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
GABARAPL3Q9BY60 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
GABARAPL3Q9BY60 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
GABARAPL3Q9BY60 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
GABARAPL3Q9BY60 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC12.99□□□□□ -0.33
GABARAPL3Q9BY60 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
GABARAPL3Q9BY60 NHEJ1-201ENST00000356853 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GABARAPL3Q9BY60 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
GABARAPL3Q9BY60 RAB42-201ENST00000373826 1950 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GABARAPL3Q9BY60 ATG5-202ENST00000360666 2712 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GABARAPL3Q9BY60 RAB37-205ENST00000392614 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
GABARAPL3Q9BY60 TNN-202ENST00000621086 4234 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
GABARAPL3Q9BY60 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GABARAPL3Q9BY60 TRIM4-203ENST00000355947 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GABARAPL3Q9BY60 CNOT7-211ENST00000523917 1885 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
GABARAPL3Q9BY60 POTEB3-201ENST00000611217 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GABARAPL3Q9BY60 NT5DC4-201ENST00000327581 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.3 ms