Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC13□□□□□ -0.33
C4orf17Q53FE4 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
C4orf17Q53FE4 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
C4orf17Q53FE4 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
C4orf17Q53FE4 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
C4orf17Q53FE4 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
C4orf17Q53FE4 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
C4orf17Q53FE4 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
C4orf17Q53FE4 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
C4orf17Q53FE4 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
C4orf17Q53FE4 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
C4orf17Q53FE4 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
C4orf17Q53FE4 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
C4orf17Q53FE4 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
C4orf17Q53FE4 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
C4orf17Q53FE4 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
C4orf17Q53FE4 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
C4orf17Q53FE4 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
C4orf17Q53FE4 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
C4orf17Q53FE4 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
C4orf17Q53FE4 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
C4orf17Q53FE4 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
C4orf17Q53FE4 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
C4orf17Q53FE4 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
C4orf17Q53FE4 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
C4orf17Q53FE4 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
C4orf17Q53FE4 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
C4orf17Q53FE4 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
C4orf17Q53FE4 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
C4orf17Q53FE4 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
C4orf17Q53FE4 RTN1-203ENST00000395090 1609 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
C4orf17Q53FE4 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
C4orf17Q53FE4 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
C4orf17Q53FE4 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
C4orf17Q53FE4 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
C4orf17Q53FE4 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
C4orf17Q53FE4 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
C4orf17Q53FE4 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
C4orf17Q53FE4 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
C4orf17Q53FE4 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
C4orf17Q53FE4 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
C4orf17Q53FE4 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
C4orf17Q53FE4 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
C4orf17Q53FE4 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
C4orf17Q53FE4 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
C4orf17Q53FE4 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
C4orf17Q53FE4 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
C4orf17Q53FE4 CHTF8-204ENST00000518041 567 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
C4orf17Q53FE4 AF111169.3-201ENST00000553991 756 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
C4orf17Q53FE4 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
C4orf17Q53FE4 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
C4orf17Q53FE4 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
C4orf17Q53FE4 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
C4orf17Q53FE4 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
C4orf17Q53FE4 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
C4orf17Q53FE4 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
C4orf17Q53FE4 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
C4orf17Q53FE4 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
C4orf17Q53FE4 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
C4orf17Q53FE4 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
C4orf17Q53FE4 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
C4orf17Q53FE4 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
C4orf17Q53FE4 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
C4orf17Q53FE4 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
C4orf17Q53FE4 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
C4orf17Q53FE4 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
C4orf17Q53FE4 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
C4orf17Q53FE4 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
C4orf17Q53FE4 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
C4orf17Q53FE4 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
C4orf17Q53FE4 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
C4orf17Q53FE4 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
C4orf17Q53FE4 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
C4orf17Q53FE4 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
C4orf17Q53FE4 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
C4orf17Q53FE4 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
C4orf17Q53FE4 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
C4orf17Q53FE4 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
C4orf17Q53FE4 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
C4orf17Q53FE4 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
C4orf17Q53FE4 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
C4orf17Q53FE4 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
C4orf17Q53FE4 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
C4orf17Q53FE4 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
C4orf17Q53FE4 CD74-202ENST00000353334 1449 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
C4orf17Q53FE4 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
C4orf17Q53FE4 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
C4orf17Q53FE4 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
C4orf17Q53FE4 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
C4orf17Q53FE4 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
C4orf17Q53FE4 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
C4orf17Q53FE4 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
C4orf17Q53FE4 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
C4orf17Q53FE4 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
C4orf17Q53FE4 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
C4orf17Q53FE4 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
C4orf17Q53FE4 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
C4orf17Q53FE4 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
C4orf17Q53FE4 ODF3L1-201ENST00000332145 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
C4orf17Q53FE4 FAM3B-201ENST00000357985 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 307.5 ms