Protein–RNA interactions for Protein: Q02246

CNTN2, Contactin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN2Q02246 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 NIPA1-207ENST00000561183 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 FLJ37035-201ENST00000419400 446 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 HTATIP2-202ENST00000421577 886 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 FAM92A-202ENST00000423990 914 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 LINC02557-201ENST00000432249 477 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 DSG1-202ENST00000462981 1857 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 TREHP1-201ENST00000531328 465 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 AC011921.1-201ENST00000559739 557 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 TRMT112P3-201ENST00000580149 358 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 SNHG15-205ENST00000580458 710 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 AC011247.3-201ENST00000603297 438 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 ASGR1-209ENST00000619926 1384 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 GOLGA8UP-201ENST00000527159 1755 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 FDFT1-214ENST00000528812 2013 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 AC018814.1-201ENST00000418972 357 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 AADACL2-AS1-202ENST00000483843 628 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 LAMTOR4-209ENST00000488241 613 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 RPS23-207ENST00000511844 530 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 ADM-203ENST00000525063 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 ZNF268-210ENST00000541211 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 TNFSF13B-206ENST00000542136 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 HIST2H2BF-204ENST00000545683 999 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 TROAP-213ENST00000550709 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 AC010976.2-201ENST00000609697 852 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 CCDC113-206ENST00000616795 891 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 LUC7L2-208ENST00000541170 1525 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 FUCA1P1-201ENST00000374476 1351 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTN2Q02246 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms