Protein–RNA interactions for Protein: P60508

ERVFRD-1, Syncytin-2, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFRD-1P60508 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 IKZF1-204ENST00000349824 5757 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 PGAM1P5-202ENST00000552554 2148 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 GRWD1-201ENST00000253237 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 AC098936.1-201ENST00000442318 2885 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 PLCD4-202ENST00000417849 2738 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 TOMM40L-209ENST00000545897 2807 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 LHX6-210ENST00000559895 3587 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 ACTR2-202ENST00000377982 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 FBN3-207ENST00000601739 9086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 CAMKV-209ENST00000477224 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 RGS12-202ENST00000338806 3010 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 CELF4-201ENST00000334919 3542 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 SNCAIP-203ENST00000379538 2588 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 ACOX1-201ENST00000293217 7514 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 SEC14L3-204ENST00000403066 2474 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
ERVFRD-1P60508 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms