Protein–RNA interactions for Protein: P53803

POLR2K, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2KP53803 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC10.15□□□□□ -0.78
POLR2KP53803 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
POLR2KP53803 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
POLR2KP53803 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
POLR2KP53803 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
POLR2KP53803 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
POLR2KP53803 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
POLR2KP53803 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
POLR2KP53803 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
POLR2KP53803 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
POLR2KP53803 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.15□□□□□ -0.78
POLR2KP53803 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
POLR2KP53803 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
POLR2KP53803 ASB2-201ENST00000315988 2743 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
POLR2KP53803 FGGY-201ENST00000303721 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
POLR2KP53803 PDE9A-202ENST00000328862 1956 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
POLR2KP53803 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
POLR2KP53803 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
POLR2KP53803 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
POLR2KP53803 TRPV1-206ENST00000571088 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
POLR2KP53803 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 SPATA12-201ENST00000334325 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 PCGF2-202ENST00000611883 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 TFR2-205ENST00000462107 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 PRKN-205ENST00000366897 2877 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 NIPSNAP3A-201ENST00000374767 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 SFI1-208ENST00000432498 4162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 AC105345.1-202ENST00000382488 3204 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 TTC14-202ENST00000382584 2274 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 SERPINH1-205ENST00000525876 2283 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 FAM219A-207ENST00000379089 3624 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 RIN3-212ENST00000620541 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 MDM1-201ENST00000303145 2918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 RCAN2-204ENST00000405162 2457 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 RTN3-210ENST00000540798 3124 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 YWHAQ-202ENST00000381844 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 CRY2-202ENST00000443527 4203 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 STRIP2-202ENST00000435494 2866 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 ABCC10-204ENST00000372530 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 NDRG4-236ENST00000566192 3265 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 DLGAP1-202ENST00000400145 2188 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 SNORA50C-201ENST00000408535 133 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC10.14□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.14□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 SNORA50.1-201ENST00000628590 135 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 GMEB2-203ENST00000370077 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 TRIM4-203ENST00000355947 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 ADCY4-202ENST00000418030 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 SLC5A5-201ENST00000222248 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 MIER1-202ENST00000355977 3595 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 ZMYND10-201ENST00000231749 2896 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 EFEMP1-201ENST00000355426 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
POLR2KP53803 TMEM192-203ENST00000506087 2225 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms