Protein–RNA interactions for Protein: P33897

ABCD1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD1P33897 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABCD1P33897 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABCD1P33897 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABCD1P33897 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABCD1P33897 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABCD1P33897 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ABCD1P33897 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABCD1P33897 AC022182.2-201ENST00000525556 859 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABCD1P33897 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABCD1P33897 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABCD1P33897 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABCD1P33897 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABCD1P33897 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABCD1P33897 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABCD1P33897 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABCD1P33897 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABCD1P33897 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABCD1P33897 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABCD1P33897 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABCD1P33897 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABCD1P33897 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABCD1P33897 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ABCD1P33897 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABCD1P33897 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABCD1P33897 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABCD1P33897 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABCD1P33897 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ABCD1P33897 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABCD1P33897 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABCD1P33897 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABCD1P33897 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABCD1P33897 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABCD1P33897 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABCD1P33897 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCD1P33897 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCD1P33897 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCD1P33897 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCD1P33897 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCD1P33897 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCD1P33897 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCD1P33897 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCD1P33897 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCD1P33897 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCD1P33897 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCD1P33897 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCD1P33897 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCD1P33897 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCD1P33897 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCD1P33897 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCD1P33897 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCD1P33897 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCD1P33897 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCD1P33897 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCD1P33897 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCD1P33897 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCD1P33897 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCD1P33897 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCD1P33897 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCD1P33897 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCD1P33897 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCD1P33897 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCD1P33897 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCD1P33897 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCD1P33897 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCD1P33897 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCD1P33897 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCD1P33897 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCD1P33897 CR392039.2-201ENST00000623182 509 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCD1P33897 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCD1P33897 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCD1P33897 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCD1P33897 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCD1P33897 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCD1P33897 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCD1P33897 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCD1P33897 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCD1P33897 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCD1P33897 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCD1P33897 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCD1P33897 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCD1P33897 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCD1P33897 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCD1P33897 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCD1P33897 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ABCD1P33897 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ABCD1P33897 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ABCD1P33897 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ABCD1P33897 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ABCD1P33897 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ABCD1P33897 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ABCD1P33897 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ABCD1P33897 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ABCD1P33897 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ABCD1P33897 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ABCD1P33897 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ABCD1P33897 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ABCD1P33897 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ABCD1P33897 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ABCD1P33897 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ABCD1P33897 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms