Protein–RNA interactions for Protein: P25490

YY1, Transcriptional repressor protein YY1, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YY1P25490 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
YY1P25490 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
YY1P25490 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
YY1P25490 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
YY1P25490 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
YY1P25490 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
YY1P25490 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
YY1P25490 RNF123-203ENST00000433785 1555 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
YY1P25490 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
YY1P25490 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
YY1P25490 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
YY1P25490 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
YY1P25490 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
YY1P25490 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
YY1P25490 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
YY1P25490 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
YY1P25490 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
YY1P25490 AC023509.3-202ENST00000591834 1609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
YY1P25490 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
YY1P25490 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
YY1P25490 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
YY1P25490 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
YY1P25490 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
YY1P25490 CALML6-201ENST00000307786 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
YY1P25490 OR52N1-201ENST00000317078 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
YY1P25490 C6orf48-202ENST00000375635 610 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
YY1P25490 AIMP2-203ENST00000400479 1107 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
YY1P25490 AC145285.1-201ENST00000469929 694 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
YY1P25490 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
YY1P25490 AC022217.2-201ENST00000518941 472 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
YY1P25490 C8orf37-AS1-203ENST00000521905 617 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
YY1P25490 BMF-209ENST00000561282 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
YY1P25490 AP001180.4-201ENST00000584167 823 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
YY1P25490 SMIM22-206ENST00000589327 629 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
YY1P25490 ZNF677-207ENST00000598806 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
YY1P25490 AC245884.8-201ENST00000599382 880 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
YY1P25490 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
YY1P25490 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
YY1P25490 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
YY1P25490 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
YY1P25490 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
YY1P25490 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
YY1P25490 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
YY1P25490 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
YY1P25490 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
YY1P25490 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
YY1P25490 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
YY1P25490 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
YY1P25490 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
YY1P25490 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
YY1P25490 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
YY1P25490 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
YY1P25490 TMEM74B-201ENST00000381894 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
YY1P25490 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
YY1P25490 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
YY1P25490 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
YY1P25490 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
YY1P25490 OR7E155P-201ENST00000412208 1014 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
YY1P25490 RPP30-203ENST00000413330 1004 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
YY1P25490 ZBTB46-AS1-201ENST00000435912 533 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
YY1P25490 RPL3P9-201ENST00000463217 1183 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
YY1P25490 SMCO4-202ENST00000525141 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
YY1P25490 AL139316.1-201ENST00000555643 568 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
YY1P25490 AC010601.1-201ENST00000569048 446 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
YY1P25490 MED11-203ENST00000575284 652 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
YY1P25490 AC003965.2-201ENST00000577140 265 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
YY1P25490 SOX2-OT-228ENST00000597828 864 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
YY1P25490 AL136084.3-201ENST00000605631 439 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
YY1P25490 AC006449.2-201ENST00000618407 486 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
YY1P25490 TP63-206ENST00000392463 1386 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
YY1P25490 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
YY1P25490 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
YY1P25490 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
YY1P25490 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
YY1P25490 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
YY1P25490 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
YY1P25490 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
YY1P25490 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
YY1P25490 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
YY1P25490 NAAA-203ENST00000505594 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
YY1P25490 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
YY1P25490 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
YY1P25490 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
YY1P25490 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
YY1P25490 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
YY1P25490 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
YY1P25490 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
YY1P25490 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
YY1P25490 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
YY1P25490 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
YY1P25490 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
YY1P25490 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
YY1P25490 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
YY1P25490 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
YY1P25490 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
YY1P25490 ASMT-203ENST00000381241 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
YY1P25490 U3.5-201ENST00000363448 216 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
YY1P25490 FATE1-201ENST00000370350 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
YY1P25490 C6orf48-209ENST00000395789 952 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
YY1P25490 GAPDH-204ENST00000396859 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms