Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
HOXA3O43365 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
HOXA3O43365 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
HOXA3O43365 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
HOXA3O43365 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
HOXA3O43365 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
HOXA3O43365 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
HOXA3O43365 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
HOXA3O43365 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
HOXA3O43365 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
HOXA3O43365 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
HOXA3O43365 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
HOXA3O43365 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
HOXA3O43365 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
HOXA3O43365 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
HOXA3O43365 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
HOXA3O43365 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
HOXA3O43365 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
HOXA3O43365 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
HOXA3O43365 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
HOXA3O43365 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
HOXA3O43365 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
HOXA3O43365 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
HOXA3O43365 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
HOXA3O43365 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
HOXA3O43365 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
HOXA3O43365 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
HOXA3O43365 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC11.55□□□□□ -0.56
HOXA3O43365 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
HOXA3O43365 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
HOXA3O43365 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
HOXA3O43365 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
HOXA3O43365 UBE3A-228ENST00000638155 9131 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
HOXA3O43365 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
HOXA3O43365 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
HOXA3O43365 KPNA4-201ENST00000334256 8981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
HOXA3O43365 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
HOXA3O43365 KIF1A-213ENST00000498729 9221 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
HOXA3O43365 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
HOXA3O43365 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.55□□□□□ -0.56
HOXA3O43365 FAM171B-201ENST00000304698 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
HOXA3O43365 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
HOXA3O43365 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
HOXA3O43365 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
HOXA3O43365 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
HOXA3O43365 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
HOXA3O43365 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
HOXA3O43365 CHL1-201ENST00000256509 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
HOXA3O43365 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
HOXA3O43365 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
HOXA3O43365 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
HOXA3O43365 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
HOXA3O43365 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
HOXA3O43365 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
HOXA3O43365 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
HOXA3O43365 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
HOXA3O43365 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
HOXA3O43365 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
HOXA3O43365 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
HOXA3O43365 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
HOXA3O43365 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
HOXA3O43365 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
HOXA3O43365 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
HOXA3O43365 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
HOXA3O43365 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
HOXA3O43365 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
HOXA3O43365 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
HOXA3O43365 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
HOXA3O43365 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
HOXA3O43365 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
HOXA3O43365 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
HOXA3O43365 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
HOXA3O43365 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
HOXA3O43365 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
HOXA3O43365 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
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HOXA3O43365 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
HOXA3O43365 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
HOXA3O43365 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
HOXA3O43365 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC11.54□□□□□ -0.56
HOXA3O43365 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
HOXA3O43365 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
HOXA3O43365 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
HOXA3O43365 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
HOXA3O43365 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC11.54□□□□□ -0.56
HOXA3O43365 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
HOXA3O43365 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
HOXA3O43365 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
HOXA3O43365 RN7SL371P-201ENST00000578099 267 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
HOXA3O43365 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
HOXA3O43365 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
HOXA3O43365 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
HOXA3O43365 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
HOXA3O43365 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
HOXA3O43365 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
HOXA3O43365 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
HOXA3O43365 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
HOXA3O43365 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
HOXA3O43365 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
HOXA3O43365 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
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