Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
RRBP1Q9P2E9 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
RRBP1Q9P2E9 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
RRBP1Q9P2E9 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
RRBP1Q9P2E9 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 POPDC2-201ENST00000264231 1679 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 ZIK1-201ENST00000307468 2510 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 SLC43A3-214ENST00000529554 2207 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 PDLIM5-203ENST00000359265 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 G0S2-201ENST00000367029 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 AC006329.1-201ENST00000419422 705 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 RFX8-201ENST00000428343 1686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 LIMK1-208ENST00000538333 2170 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 MEFV-203ENST00000536379 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 ETNPPL-206ENST00000510706 1692 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 UPK1A-202ENST00000379013 1016 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 GAS7-216ENST00000583882 553 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 EIF3F-209ENST00000640290 372 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 AAR2-203ENST00000397286 1466 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 DDX46-212ENST00000628477 1584 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 PPP1R32-201ENST00000338608 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 PGAM2-201ENST00000297283 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 DERL3-202ENST00000318109 860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 HCRTR1-201ENST00000373705 1170 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 OR2W2P-201ENST00000406313 909 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 AC099567.1-201ENST00000414418 931 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 FTCDNL1-203ENST00000420922 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 FAM3D-AS1-201ENST00000464125 821 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 RN7SL556P-201ENST00000582856 298 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RRBP1Q9P2E9 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms