Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 PEAR1-202ENST00000338302 4970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 TRIM11-204ENST00000493030 5774 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 LAMB1-201ENST00000222399 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 ZNF843-202ENST00000564218 3816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 TGM1-201ENST00000206765 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 TRAF3-208ENST00000560371 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FANCFQ9NPI8 REV3L-207ENST00000435970 10943 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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