Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD4

TRIM47, Tripartite motif-containing protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM47Q96LD4 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 AP005131.2-201ENST00000589045 487 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 HKR1-225ENST00000592168 566 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 AC073592.2-201ENST00000623062 780 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 AL118516.1-201ENST00000564152 670 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 KRT16P3-202ENST00000580113 1012 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 KRT16P1-203ENST00000581027 1012 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 HCG27-204ENST00000424675 895 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 AL365436.2-201ENST00000434112 526 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 SNHG17-208ENST00000456953 546 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 AC245884.1-201ENST00000457113 529 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM47Q96LD4 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms